More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4001 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  99.35 
 
 
460 aa  964  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  81.52 
 
 
462 aa  812  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  99.35 
 
 
460 aa  962  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  99.35 
 
 
460 aa  962  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  100 
 
 
460 aa  967  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  64.86 
 
 
461 aa  642  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  99.13 
 
 
460 aa  962  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  78.56 
 
 
465 aa  778  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  66.52 
 
 
470 aa  657  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  78.56 
 
 
470 aa  777  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  61.66 
 
 
464 aa  618  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  56.11 
 
 
461 aa  577  1e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.85051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  55.53 
 
 
460 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  53.83 
 
 
459 aa  546  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  53.83 
 
 
470 aa  542  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  52.93 
 
 
461 aa  534  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  53.51 
 
 
457 aa  521  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  53.03 
 
 
459 aa  506  1e-142  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  51.95 
 
 
459 aa  501  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  48.48 
 
 
469 aa  484  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  46.42 
 
 
475 aa  417  1e-115  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  46.49 
 
 
479 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  42.95 
 
 
478 aa  358  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  41.14 
 
 
452 aa  358  1e-97  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  42.6 
 
 
478 aa  357  3e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  41.28 
 
 
478 aa  349  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 
475 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  39.35 
 
 
465 aa  340  3e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  36.99 
 
 
467 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  36.46 
 
 
446 aa  315  1e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  36.24 
 
 
446 aa  312  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  37 
 
 
451 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  37.42 
 
 
444 aa  305  1e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  35.67 
 
 
453 aa  303  5e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  37.47 
 
 
457 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  34.49 
 
 
471 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  33.92 
 
 
474 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  35.62 
 
 
465 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  36.9 
 
 
459 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  36.14 
 
 
458 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  36.17 
 
 
469 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  33.91 
 
 
446 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  35.82 
 
 
439 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.38 
 
 
450 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  36.81 
 
 
457 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  35.67 
 
 
463 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  36.7 
 
 
470 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  35.59 
 
 
446 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  34.91 
 
 
478 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  35.25 
 
 
451 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  35.42 
 
 
476 aa  286  6e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  36.14 
 
 
438 aa  285  1e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  34.18 
 
 
468 aa  285  1e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.64556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  35.1 
 
 
478 aa  283  4e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  35.96 
 
 
482 aa  283  6e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  34.17 
 
 
478 aa  282  9e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  33.05 
 
 
487 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  36 
 
 
453 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  35.78 
 
 
478 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  34.85 
 
 
469 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  36.2 
 
 
468 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  35.64 
 
 
474 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  34.87 
 
 
472 aa  279  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  34.21 
 
 
488 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  36.59 
 
 
457 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  36.22 
 
 
443 aa  276  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  35.33 
 
 
474 aa  275  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  35.37 
 
 
494 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  34.29 
 
 
467 aa  274  2e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  33.86 
 
 
445 aa  275  2e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  33.19 
 
 
452 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  35.24 
 
 
478 aa  273  4e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  35.98 
 
 
448 aa  273  4e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  36.36 
 
 
448 aa  273  5e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  35.24 
 
 
458 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  32.48 
 
 
452 aa  270  3e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  34.28 
 
 
454 aa  270  6e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  34.36 
 
 
439 aa  269  8e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  33.47 
 
 
470 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  34.03 
 
 
517 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  34.51 
 
 
455 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  34.75 
 
 
909 aa  267  3e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  35.57 
 
 
482 aa  267  3e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  33.7 
 
 
467 aa  267  3e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  35.81 
 
 
436 aa  267  3e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  34.06 
 
 
448 aa  267  3e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  35.63 
 
 
453 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  33.83 
 
 
484 aa  267  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  33.76 
 
 
499 aa  267  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  33.77 
 
 
472 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  34.32 
 
 
478 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  33.19 
 
 
479 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  32.96 
 
 
450 aa  263  7e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  33.33 
 
 
469 aa  262  8e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.97092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  34.29 
 
 
465 aa  262  9e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  34.48 
 
 
466 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  35.34 
 
 
479 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  33.12 
 
 
462 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  36.42 
 
 
445 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  35.41 
 
 
447 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>