112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1177 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
392 aa  777    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  60.73 
 
 
382 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  42.86 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  39.07 
 
 
387 aa  295  8e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  42.53 
 
 
387 aa  280  4e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.05 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  37.47 
 
 
392 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.48 
 
 
391 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.11 
 
 
387 aa  266  5e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.96 
 
 
391 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.67 
 
 
391 aa  258  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 
389 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
611 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  26.37 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  27.81 
 
 
614 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 
614 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 
614 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
719 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  25.68 
 
 
609 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.67 
 
 
609 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.67 
 
 
609 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 
609 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.21 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  25.21 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  25.21 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.21 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.8 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  25.8 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.21 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.41 
 
 
609 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.75 
 
 
609 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 
530 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 
609 aa  69.7  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.8 
 
 
608 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
698 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 
751 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 
727 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  23.03 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 
698 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.63 
 
 
379 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  28.52 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  23.78 
 
 
715 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  23.75 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  23.06 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  24.41 
 
 
649 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  22.66 
 
 
708 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.25 
 
 
648 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2766  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
394 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
716 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  23.49 
 
 
709 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 
474 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  24.18 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  26.36 
 
 
585 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  23.21 
 
 
649 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.19 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  24.41 
 
 
648 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  24.41 
 
 
648 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  24.41 
 
 
648 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
692 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.49 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  25.08 
 
 
649 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  24.41 
 
 
648 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  23.2 
 
 
688 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 
732 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  24.09 
 
 
716 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
388 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  23.19 
 
 
390 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  23.74 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  24.75 
 
 
650 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 
653 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 
557 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  22.03 
 
 
712 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 
674 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  24.23 
 
 
648 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  23.23 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  25.82 
 
 
649 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  23.33 
 
 
721 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  22.02 
 
 
482 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  21.24 
 
 
686 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  25.48 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 
467 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 
467 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  26.42 
 
 
662 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 
406 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>