238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0009 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  73.54 
 
 
223 aa  350  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  63.64 
 
 
225 aa  292  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  58.72 
 
 
224 aa  273  1e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.1363e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  56.82 
 
 
229 aa  273  2e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  58.64 
 
 
233 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  59.45 
 
 
222 aa  271  8e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  58.64 
 
 
232 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  59.64 
 
 
223 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 
231 aa  265  3e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  58.18 
 
 
220 aa  263  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  56.31 
 
 
231 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  57.66 
 
 
222 aa  263  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  58.06 
 
 
221 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  58.37 
 
 
221 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  59.15 
 
 
218 aa  262  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  59.15 
 
 
218 aa  262  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  55.81 
 
 
226 aa  261  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 
226 aa  262  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.79843e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  56.16 
 
 
225 aa  262  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  56.82 
 
 
231 aa  261  5e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  56.82 
 
 
231 aa  261  5e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 
225 aa  261  9e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  56.62 
 
 
225 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  56.62 
 
 
225 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  55.45 
 
 
230 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  59.42 
 
 
218 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 
223 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
230 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  56.11 
 
 
221 aa  258  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  57.6 
 
 
221 aa  258  5e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 
241 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 
225 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  54.95 
 
 
225 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 
225 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 
225 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 
229 aa  255  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 
225 aa  255  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 
229 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  56.11 
 
 
269 aa  254  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.1966e-11  hitchhiker  5.89305e-06 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 
225 aa  254  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  54.95 
 
 
225 aa  254  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 
225 aa  254  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 
225 aa  253  1e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 
225 aa  254  1e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 
225 aa  254  1e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 
229 aa  253  2e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  55.66 
 
 
221 aa  253  2e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  58.82 
 
 
231 aa  251  4e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  53.64 
 
 
253 aa  252  4e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 
235 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  55.4 
 
 
216 aa  251  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  55.35 
 
 
240 aa  251  9e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21985e-05  hitchhiker  1.31635e-09 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  53.64 
 
 
253 aa  250  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  55.45 
 
 
230 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 
232 aa  249  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  54.67 
 
 
245 aa  249  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  55.45 
 
 
230 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
261 aa  248  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  59.28 
 
 
235 aa  248  6e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  57.47 
 
 
230 aa  248  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  55.45 
 
 
230 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  55.45 
 
 
230 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  57.47 
 
 
232 aa  247  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
243 aa  246  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  53.42 
 
 
233 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  53.42 
 
 
229 aa  245  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 
247 aa  244  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
241 aa  244  1e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
228 aa  243  1e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 
245 aa  243  2e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  55.3 
 
 
225 aa  242  4e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
228 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
228 aa  238  7e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  54.63 
 
 
228 aa  238  7e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 
225 aa  237  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  54.84 
 
 
225 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
229 aa  236  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
229 aa  234  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
227 aa  234  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.21221e-06  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  52.05 
 
 
244 aa  233  1e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
237 aa  233  1e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
229 aa  234  1e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  53.92 
 
 
229 aa  234  1e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  51.11 
 
 
225 aa  233  2e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
229 aa  233  2e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  52.07 
 
 
223 aa  233  2e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 
224 aa  232  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
221 aa  232  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  53.99 
 
 
217 aa  232  4e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.82189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
229 aa  231  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
229 aa  231  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
229 aa  231  7e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00069e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
229 aa  231  7e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
229 aa  231  7e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
229 aa  231  7e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
226 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
222 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  50.68 
 
 
227 aa  229  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
229 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>