More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2200 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  100 
 
 		 587 aa  1135    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  60.34 
 
 		 580 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  33.84 
 
 		 687 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  54.84 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  54.84 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  57.69 
 
 		 494 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  58.82 
 
 		 272 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  60 
 
 		 609 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  55.68 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  49.79 
 
 		 294 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  58.82 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  52.09 
 
 		 294 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  56.4 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  41.72 
 
 		 467 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  59.41 
 
 		 492 aa  190  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  39.66 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  54.3 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  40.18 
 
 		 488 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  53.23 
 
 		 484 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 272 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.8 
 
 		 280 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.81 
 
 		 276 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  55.56 
 
 		 482 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  57.06 
 
 		 490 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  41.41 
 
 		 468 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  55.56 
 
 		 481 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  62.89 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  55.29 
 
 		 501 aa  180  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  58.05 
 
 		 319 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  60 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  52.81 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  59.12 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  54.95 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  57.39 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  52 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  52 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  52.25 
 
 		 394 aa  177  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  59.24 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  55.17 
 
 		 319 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  36.31 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  51.6 
 
 		 272 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  58.39 
 
 		 274 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  53.59 
 
 		 405 aa  173  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  52.8 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  51.87 
 
 		 271 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  56.05 
 
 		 379 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  50.29 
 
 		 377 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1039  flagellin domain protein  50.56 
 
 		 278 aa  172  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  51.72 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  56.73 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.48 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  59.75 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  53.53 
 
 		 375 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  53.53 
 
 		 483 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  51.74 
 
 		 276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  44.81 
 
 		 402 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  57.5 
 
 		 431 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  51.08 
 
 		 271 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2433  flagellin domain-containing protein  48.28 
 
 		 548 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  56.69 
 
 		 492 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  50.81 
 
 		 271 aa  167  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  49.2 
 
 		 271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  49.2 
 
 		 271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  45.82 
 
 		 277 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  55.88 
 
 		 384 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  55.88 
 
 		 384 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  50.8 
 
 		 271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  49.13 
 
 		 379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  53.5 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  48.68 
 
 		 276 aa  165  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  47.78 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  50.27 
 
 		 271 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  50.27 
 
 		 271 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  51.15 
 
 		 376 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  51.5 
 
 		 380 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  55.35 
 
 		 404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  52.6 
 
 		 376 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  51.67 
 
 		 395 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  46.75 
 
 		 276 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  48.68 
 
 		 392 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  40.48 
 
 		 282 aa  163  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  52.23 
 
 		 384 aa  163  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  50.8 
 
 		 271 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  50.8 
 
 		 271 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  50.59 
 
 		 272 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  50.59 
 
 		 272 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  48.55 
 
 		 376 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  54.67 
 
 		 314 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  54.71 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  53.46 
 
 		 404 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  50.31 
 
 		 385 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  40.14 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  52.5 
 
 		 263 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  36.42 
 
 		 513 aa  160  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  49.45 
 
 		 282 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  51.15 
 
 		 275 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  52.35 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  52.35 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  53.25 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>