134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0096 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  429  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  97.56 
 
 
205 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  97.56 
 
 
205 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  97.07 
 
 
205 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  57.14 
 
 
206 aa  252  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  55.67 
 
 
227 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  55.67 
 
 
227 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  55.67 
 
 
227 aa  244  7e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  51.47 
 
 
205 aa  230  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.81 
 
 
207 aa  197  8e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  44.29 
 
 
219 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.6 
 
 
207 aa  152  3e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.71 
 
 
200 aa  141  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  38.65 
 
 
217 aa  140  1e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  39.3 
 
 
205 aa  140  2e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  39.42 
 
 
213 aa  137  9e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.08 
 
 
201 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  37.62 
 
 
199 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.42 
 
 
202 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  38.12 
 
 
219 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.8 
 
 
207 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.57 
 
 
210 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.61 
 
 
199 aa  135  3e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.61 
 
 
199 aa  135  3e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  41.08 
 
 
199 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.83 
 
 
207 aa  135  6e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  37.2 
 
 
212 aa  135  6e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.27 
 
 
227 aa  134  7e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.89 
 
 
212 aa  134  7e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  38.12 
 
 
199 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  37.5 
 
 
212 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.32 
 
 
207 aa  134  1e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.83 
 
 
207 aa  133  2e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.96 
 
 
217 aa  133  2e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.83 
 
 
207 aa  133  2e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.83 
 
 
207 aa  133  2e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.83 
 
 
207 aa  133  2e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  38.83 
 
 
207 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  36.68 
 
 
202 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  38.58 
 
 
212 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.44 
 
 
204 aa  129  4e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  36.07 
 
 
205 aa  127  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.56 
 
 
212 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.56 
 
 
212 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  35.18 
 
 
201 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.54 
 
 
209 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  37.56 
 
 
212 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.7 
 
 
209 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  4.72337e-07 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.58 
 
 
216 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.54 
 
 
209 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.06 
 
 
212 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.82 
 
 
212 aa  120  1e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  36.55 
 
 
212 aa  120  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.7 
 
 
224 aa  119  2e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.04 
 
 
209 aa  119  4e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  1.84887e-05  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  36.65 
 
 
213 aa  118  5e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.18 
 
 
212 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  35.38 
 
 
216 aa  117  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.46 
 
 
236 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  36.73 
 
 
253 aa  115  4e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  36.08 
 
 
212 aa  115  4e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 
212 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  36.73 
 
 
212 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 
212 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  36.73 
 
 
212 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 
212 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  36.73 
 
 
212 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  35.53 
 
 
212 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  35.53 
 
 
212 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.18 
 
 
211 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  35.75 
 
 
212 aa  114  7e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  35.33 
 
 
210 aa  114  7e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  35.78 
 
 
207 aa  114  1e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.03 
 
 
212 aa  114  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  36.36 
 
 
205 aa  114  1e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.03 
 
 
214 aa  114  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.69 
 
 
208 aa  113  1e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  35.6 
 
 
214 aa  114  1e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.39 
 
 
209 aa  113  2e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.45 
 
 
214 aa  113  2e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.98 
 
 
208 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.65 
 
 
214 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  34.72 
 
 
212 aa  112  4e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  34.45 
 
 
216 aa  112  4e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  36.22 
 
 
212 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.19 
 
 
207 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  34.18 
 
 
208 aa  111  1e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  34.2 
 
 
232 aa  110  1e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.18 
 
 
206 aa  110  1e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.12 
 
 
208 aa  110  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.18 
 
 
218 aa  109  2e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  35.6 
 
 
201 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.64 
 
 
207 aa  107  9e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  32.49 
 
 
218 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  33.17 
 
 
223 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2362  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.31 
 
 
203 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  34.63 
 
 
212 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 
207 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  34.5 
 
 
210 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.35 
 
 
223 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>