More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0009 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  100 
 
 
111 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  100 
 
 
111 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  96.4 
 
 
111 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.57526e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  81.08 
 
 
111 aa  186  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  55.17 
 
 
136 aa  108  2e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  48.81 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-06 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  39.22 
 
 
221 aa  75.5  2e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  44.74 
 
 
98 aa  74.7  4e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  44.58 
 
 
205 aa  72.8  2e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  47.69 
 
 
100 aa  71.2  4e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  40.95 
 
 
222 aa  69.7  1e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  40.95 
 
 
222 aa  69.7  1e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.22 
 
 
318 aa  67  8e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  35.45 
 
 
108 aa  66.6  1e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  43.53 
 
 
196 aa  66.6  1e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  37.74 
 
 
205 aa  66.6  1e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  37.04 
 
 
209 aa  65.5  2e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  41.67 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  40.96 
 
 
226 aa  65.1  3e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  39.77 
 
 
217 aa  64.7  4e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  39.77 
 
 
217 aa  64.7  4e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  37.89 
 
 
98 aa  64.3  5e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  35.78 
 
 
200 aa  64.3  5e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  35.96 
 
 
206 aa  63.5  1e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  7.81089e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  38.64 
 
 
217 aa  62  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  37.76 
 
 
109 aa  62.4  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.71 
 
 
265 aa  62.8  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  42.42 
 
 
103 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  33.05 
 
 
219 aa  62.8  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  33.33 
 
 
206 aa  62.4  2e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.64 
 
 
207 aa  61.6  4e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
206 aa  61.6  4e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.45105e-09  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  38.64 
 
 
217 aa  61.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  34.55 
 
 
220 aa  61.2  5e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  40 
 
 
217 aa  60.8  5e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  38.64 
 
 
217 aa  61.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  38.64 
 
 
217 aa  61.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.3 
 
 
206 aa  60.8  6e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  35.58 
 
 
205 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  45.59 
 
 
129 aa  60.8  7e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  35.58 
 
 
205 aa  60.5  8e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  35.58 
 
 
205 aa  60.5  8e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  33.06 
 
 
265 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  35.58 
 
 
106 aa  60.1  1e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  36.78 
 
 
205 aa  60.1  1e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  33.06 
 
 
265 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  38.14 
 
 
108 aa  59.7  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  33.06 
 
 
215 aa  59.3  2e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  31.78 
 
 
237 aa  58.9  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  35.92 
 
 
104 aa  59.3  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  34.95 
 
 
203 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  36.84 
 
 
206 aa  58.5  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  36.84 
 
 
206 aa  58.5  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  33.06 
 
 
545 aa  58.5  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  36.84 
 
 
206 aa  58.5  3e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  38.75 
 
 
206 aa  58.2  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  33.6 
 
 
206 aa  58.2  4e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  9.8516e-08 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  35.87 
 
 
219 aa  58.2  4e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.73 
 
 
206 aa  57.8  5e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.56417e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
226 aa  57.8  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  38.81 
 
 
113 aa  57.8  6e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.19911e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  33.65 
 
 
205 aa  57.4  7e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  30 
 
 
206 aa  57.4  7e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.63 
 
 
221 aa  57  8e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  37.86 
 
 
200 aa  57  9e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37.86 
 
 
200 aa  57  9e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
200 aa  56.2  1e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  36.47 
 
 
105 aa  56.6  1e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  35.09 
 
 
217 aa  56.2  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  3.11228e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  34.58 
 
 
202 aa  55.8  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  38.75 
 
 
179 aa  55.8  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  39.24 
 
 
205 aa  56.2  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  37.65 
 
 
209 aa  55.5  2e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  32.58 
 
 
225 aa  55.8  2e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  42.47 
 
 
262 aa  55.5  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  38.81 
 
 
110 aa  55.1  3e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  32.5 
 
 
218 aa  55.1  3e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  32.95 
 
 
207 aa  55.1  3e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  34.21 
 
 
217 aa  55.1  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  36.73 
 
 
205 aa  54.7  4e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  31.31 
 
 
205 aa  54.7  4e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  39.74 
 
 
213 aa  54.7  4e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  29.73 
 
 
207 aa  54.7  4e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  29.73 
 
 
207 aa  54.7  4e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  40 
 
 
212 aa  55.1  4e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  38.27 
 
 
255 aa  54.3  5e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  36.84 
 
 
217 aa  54.3  5e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  29.73 
 
 
207 aa  54.3  5e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  34.12 
 
 
211 aa  54.3  6e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  29.73 
 
 
207 aa  54.3  6e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  29.73 
 
 
207 aa  54.3  6e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.36847e-08  unclonable  5.12206e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  29.73 
 
 
207 aa  54.3  6e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.02028e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  42.47 
 
 
262 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  42.47 
 
 
262 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  42.47 
 
 
262 aa  54.3  6e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  29.73 
 
 
207 aa  54.3  6e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  38.96 
 
 
226 aa  53.9  7e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.9 
 
 
223 aa  53.5  8e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  36.49 
 
 
234 aa  53.5  8e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  37.88 
 
 
102 aa  53.9  8e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.35471e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>