More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1527 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  100 
 
 
346 aa  702  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  100 
 
 
346 aa  702  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  61.01 
 
 
333 aa  348  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  61.01 
 
 
333 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  61.32 
 
 
333 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  60.69 
 
 
333 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  60.69 
 
 
333 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  60.38 
 
 
333 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  61.01 
 
 
333 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  60.38 
 
 
333 aa  345  9e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  63.04 
 
 
333 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  54.26 
 
 
329 aa  312  6e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3413  threonine dehydratase  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0586  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02935  hypothetical protein  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0581  threonine dehydratase  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3591  threonine dehydratase  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02984  threonine dehydratase  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3240  threonine dehydratase  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4430  threonine dehydratase  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.119659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3305  threonine dehydratase  53.94 
 
 
329 aa  308  1e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3435  threonine dehydratase  54.26 
 
 
329 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3539  threonine dehydratase  54.26 
 
 
329 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00163646  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3602  threonine dehydratase  54.26 
 
 
329 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3506  threonine dehydratase  54.26 
 
 
329 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  48.61 
 
 
403 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3432  threonine dehydratase  54.26 
 
 
329 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  47.99 
 
 
403 aa  298  8e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  47.99 
 
 
403 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  48.76 
 
 
403 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  47.99 
 
 
405 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  47.06 
 
 
403 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  45.82 
 
 
403 aa  286  5e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  45.2 
 
 
403 aa  283  3e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  48.45 
 
 
401 aa  283  5e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  49.54 
 
 
403 aa  278  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  46.13 
 
 
403 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  45.51 
 
 
404 aa  275  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  48.15 
 
 
402 aa  275  1e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.65 
 
 
403 aa  274  1e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  44.58 
 
 
403 aa  273  4e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  48.09 
 
 
408 aa  270  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  45.43 
 
 
400 aa  269  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  46.13 
 
 
403 aa  269  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  50.31 
 
 
402 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  49.67 
 
 
402 aa  266  4e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  42.11 
 
 
402 aa  262  5e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  45.26 
 
 
408 aa  262  6e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  49.38 
 
 
401 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  49.38 
 
 
401 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  47.68 
 
 
402 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  46.37 
 
 
402 aa  258  7e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  44.48 
 
 
402 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  47.66 
 
 
418 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  48.58 
 
 
402 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  41.18 
 
 
402 aa  255  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  43.65 
 
 
403 aa  255  1e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  43.34 
 
 
403 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  44.58 
 
 
403 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.49 
 
 
415 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  52.1 
 
 
404 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  46.44 
 
 
403 aa  246  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  45.2 
 
 
537 aa  246  4e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.52 
 
 
400 aa  246  5e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  46.23 
 
 
403 aa  246  5e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  45.4 
 
 
406 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  43.96 
 
 
406 aa  245  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  42.15 
 
 
402 aa  244  1e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  45.23 
 
 
411 aa  244  1e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.25 
 
 
320 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  46.44 
 
 
403 aa  243  4e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  42.28 
 
 
399 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.14 
 
 
323 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  46.6 
 
 
401 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  40.57 
 
 
329 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.75 
 
 
332 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.03 
 
 
320 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.43 
 
 
412 aa  239  6e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  44.17 
 
 
406 aa  239  6e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  43.69 
 
 
414 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  47 
 
 
402 aa  236  5e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.64 
 
 
412 aa  235  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  46.37 
 
 
402 aa  235  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  45.71 
 
 
402 aa  235  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  44.44 
 
 
395 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  46.69 
 
 
402 aa  233  4e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  47.32 
 
 
402 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  46.65 
 
 
407 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.36 
 
 
400 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.42 
 
 
409 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  45.96 
 
 
413 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.99 
 
 
404 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  42.95 
 
 
511 aa  229  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  44.07 
 
 
412 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  41.12 
 
 
358 aa  228  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  42.41 
 
 
402 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  43.47 
 
 
408 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  42.86 
 
 
412 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  44.89 
 
 
415 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  43.79 
 
 
410 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>