More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5098 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  100 
 
 		 107 aa  219  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  90.65 
 
 		 107 aa  204  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  66.36 
 
 		 107 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  66.67 
 
 		 106 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  68.69 
 
 		 108 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  61.68 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  61.32 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  57.94 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  64.21 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  61 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  58.33 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  55.66 
 
 		 108 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  58.16 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  58.42 
 
 		 106 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  51.4 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  59.22 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  57.43 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  55.88 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.27 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  56.07 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  55.88 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  55.88 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  53.27 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  57.43 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  57.29 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  53.4 
 
 		 104 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  52.43 
 
 		 106 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  53.77 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  54.72 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  56.44 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  56.07 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  55.45 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  55.14 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  54.21 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  56 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  55.34 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  53.85 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  53.47 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  50.98 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  52.94 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  57.89 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  53.54 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  53.54 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  53.54 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  55.32 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  54.46 
 
 		 125 aa  120  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  53.47 
 
 		 106 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50.98 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50.98 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  51.49 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  53.92 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  52.34 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  119  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  56.44 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  56.44 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  52.43 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  52.43 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  54.46 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  54.46 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>