More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1684 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  684    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  95.06 
 
 
344 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  67.17 
 
 
338 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  61.42 
 
 
337 aa  411  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  60.42 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  56.63 
 
 
332 aa  378  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  54.46 
 
 
328 aa  348  9e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  38.56 
 
 
344 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  37.97 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  41.4 
 
 
361 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  40.69 
 
 
345 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
331 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  35.37 
 
 
346 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.89 
 
 
332 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  35.51 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  33.94 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.1 
 
 
313 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
335 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 
310 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  34.15 
 
 
334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.21 
 
 
312 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  32.81 
 
 
302 aa  142  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  32.34 
 
 
353 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.27 
 
 
310 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  31.42 
 
 
359 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  31.15 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.12 
 
 
335 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  31.02 
 
 
334 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  30 
 
 
334 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  32.39 
 
 
340 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 
310 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  31.61 
 
 
340 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 
355 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.75 
 
 
354 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  30.7 
 
 
334 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  31.5 
 
 
356 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 
311 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 
310 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 
303 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  32.4 
 
 
340 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  31.55 
 
 
335 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  31.29 
 
 
334 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.27 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  27.47 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.27 
 
 
288 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  39.33 
 
 
340 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  25.3 
 
 
311 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 
355 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 
339 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 
318 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.95 
 
 
288 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.71 
 
 
286 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
328 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  28.98 
 
 
316 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 
317 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
327 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
370 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
337 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
307 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
363 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  28.96 
 
 
346 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  27.99 
 
 
305 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
327 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  29.12 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.89 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 
331 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.45 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
295 aa  96.3  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  35.63 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.89 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.15 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  29.13 
 
 
649 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  30.48 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.81 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  26.85 
 
 
330 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  25.7 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  25.46 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  31.41 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>