54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1014 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  100 
 
 		 240 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  81.38 
 
 		 247 aa  324  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  49.43 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  46.08 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  41.53 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  44.32 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  47.8 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  39.18 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  42.11 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  42.92 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  38.14 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  44.52 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  44.44 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  36.47 
 
 		 277 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  41.67 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  42.41 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  38.96 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  32.35 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  32.9 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  36.77 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  32.92 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  33.07 
 
 		 264 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  27.39 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  27.7 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  31.82 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  31.52 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  28.18 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  30.77 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  30.18 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  27.63 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  26.87 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  27.63 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  31.18 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  27.63 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  29.3 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  27.19 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  26.75 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  27.19 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  27.19 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  27.19 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  25.88 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  28.12 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  29.52 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  30.29 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  27.66 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  30.86 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  28.23 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  28.14 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  27.96 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  26.62 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  24.85 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  25.31 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  31.58 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  26.13 
 
 		 324 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>