More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1664 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  57.98 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  58.82 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  56.3 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  55.65 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  52.46 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  52.46 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  54.92 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  52.46 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  52.5 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  52.46 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  137  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 140 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  50.4 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 227 aa  134  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  50 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  54.4 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  49.59 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  52.38 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  58.82 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>