256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4375 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 144 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  94.44 
 
 		 144 aa  293  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  93.75 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  93.75 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  86.11 
 
 		 144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  86.01 
 
 		 143 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  86.01 
 
 		 143 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  86.01 
 
 		 143 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 		 143 aa  266  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  70.42 
 
 		 143 aa  225  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  72.46 
 
 		 144 aa  225  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  70.71 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  69.78 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  73.91 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  67.36 
 
 		 149 aa  221  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  53.33 
 
 		 138 aa  170  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  54.62 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  55.81 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  53.38 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  52.67 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  51.13 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  54.84 
 
 		 143 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  48.2 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  46.97 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  49.23 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  48.46 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  50.38 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  48.46 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  47.2 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  42.54 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  33.87 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.57 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  30.71 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.71 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  31.76 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  31.94 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.93 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  29.17 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  23.76 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.85 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  25.23 
 
 		 136 aa  57  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  25.58 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.25 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  23.76 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  25.21 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  30.39 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>