58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1086 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  62.22 
 
 		 1157 aa  1333    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  63.39 
 
 		 1159 aa  1358    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  63.68 
 
 		 1159 aa  1367    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  63.88 
 
 		 1157 aa  1380    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  67.87 
 
 		 1132 aa  1439    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  100 
 
 		 1116 aa  2308    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  74.78 
 
 		 1120 aa  1745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  96.68 
 
 		 1116 aa  2244    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  75.04 
 
 		 1120 aa  1751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  68.17 
 
 		 1137 aa  1443    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  62.23 
 
 		 1012 aa  1138    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  68.17 
 
 		 1132 aa  1449    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  63.39 
 
 		 1158 aa  1358    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  58.22 
 
 		 837 aa  838    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  72.82 
 
 		 522 aa  793    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  62.84 
 
 		 1159 aa  1345    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  62.55 
 
 		 1159 aa  1341    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  63.97 
 
 		 1157 aa  1382    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  63.39 
 
 		 1158 aa  1358    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  67.87 
 
 		 1132 aa  1439    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  59.89 
 
 		 881 aa  925    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  39.93 
 
 		 1059 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  55.13 
 
 		 951 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  33.1 
 
 		 1051 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  39.58 
 
 		 1133 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  38.04 
 
 		 1219 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  38.04 
 
 		 1221 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  35.27 
 
 		 1103 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1100 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  33.52 
 
 		 1101 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  35.33 
 
 		 2899 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  35.23 
 
 		 3238 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  33.37 
 
 		 1092 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  34.65 
 
 		 2900 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  34.86 
 
 		 3286 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  31.85 
 
 		 1816 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  34.69 
 
 		 3521 aa  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  31.62 
 
 		 1341 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  35.16 
 
 		 2140 aa  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  35.08 
 
 		 3006 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  29.82 
 
 		 1067 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  29.98 
 
 		 1543 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  33.52 
 
 		 1061 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  32.05 
 
 		 1194 aa  363  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  32.17 
 
 		 1188 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  30.93 
 
 		 2007 aa  338  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  31.77 
 
 		 1057 aa  333  8e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.98 
 
 		 960 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  60.98 
 
 		 217 aa  102  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  23.95 
 
 		 1644 aa  93.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  30.38 
 
 		 1093 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  29.75 
 
 		 1093 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1830 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  27.31 
 
 		 2400 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  26.94 
 
 		 934 aa  51.6  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  23.08 
 
 		 918 aa  48.9  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  27.09 
 
 		 779 aa  48.5  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  20.06 
 
 		 1171 aa  47.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>