More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1280 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1280  aminotransferase, class V  100 
 
 		 379 aa  770    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0012721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1772  aminotransferase, class V  64.74 
 
 		 388 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1807  aminotransferase class V  64.74 
 
 		 388 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  40.58 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  39.53 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  43.96 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  37.27 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  41.8 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  37.01 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  38.71 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  35.77 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.7 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  40.11 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  35.84 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  39.32 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  37.2 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  36.46 
 
 		 377 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  36.91 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  38.52 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  35.86 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  35.86 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  36.75 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  37.11 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  35.79 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  34.38 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  35.79 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  35.77 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  36.05 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.02 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  37.66 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.67 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  34.54 
 
 		 502 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  37.22 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0181  aminotransferase class V  34.05 
 
 		 374 aa  226  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  34.52 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  34.52 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  36.41 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  37.14 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  36.97 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  34.38 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  36.46 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  32.98 
 
 		 407 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  31.32 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  34.91 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  35.16 
 
 		 381 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  33.95 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  34.03 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  30.97 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  36.39 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  36.91 
 
 		 407 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  36.65 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  34.12 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.37 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  34.91 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  37.01 
 
 		 395 aa  215  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  32.46 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  36.68 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  32.2 
 
 		 407 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  33.77 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  31.84 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  32.72 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  36.39 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  34.82 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  35.4 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  35.06 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  36.05 
 
 		 402 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  36.65 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  36.65 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  35.06 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  36.71 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.88 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  34.82 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  34.38 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  33.51 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  32.63 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  36.34 
 
 		 403 aa  212  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  35.81 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  34.81 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  37.26 
 
 		 419 aa  212  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  32.89 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  34.9 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  36.13 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  36.39 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>