64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0018 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2388  lipase  54.37 
 
 
643 aa  720    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  100 
 
 
681 aa  1406    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  46.05 
 
 
645 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  46.05 
 
 
645 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  43.08 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  42.26 
 
 
681 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  42.26 
 
 
681 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2336  lipase, putative  38.67 
 
 
728 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  39.59 
 
 
413 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  39.59 
 
 
413 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  39.07 
 
 
413 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  39.33 
 
 
400 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  38.82 
 
 
413 aa  253  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  38.82 
 
 
413 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  38.56 
 
 
413 aa  250  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  39.07 
 
 
413 aa  250  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  37.79 
 
 
413 aa  248  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2819  Triacylglycerol lipase  36.7 
 
 
416 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  26.34 
 
 
377 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  27.01 
 
 
561 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  27.13 
 
 
332 aa  55.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  31.32 
 
 
1337 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  26.9 
 
 
332 aa  54.3  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  31.32 
 
 
1337 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  26.02 
 
 
357 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  25.86 
 
 
364 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  25.86 
 
 
364 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  25.86 
 
 
364 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
365 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  27.59 
 
 
309 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  28.77 
 
 
965 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  24 
 
 
364 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  24.93 
 
 
339 aa  52.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  28.77 
 
 
965 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  25.29 
 
 
364 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  26.44 
 
 
364 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  24.11 
 
 
309 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  25.86 
 
 
364 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  25.86 
 
 
360 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  25.29 
 
 
364 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  25.86 
 
 
360 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  25.57 
 
 
341 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  25.57 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  26.44 
 
 
309 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  25.57 
 
 
367 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  25.57 
 
 
367 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  25.57 
 
 
367 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 
305 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  24.71 
 
 
364 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  25.57 
 
 
367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  23.86 
 
 
294 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  25.57 
 
 
367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  25.57 
 
 
367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  25.57 
 
 
367 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 
351 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  40.48 
 
 
1153 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  40.48 
 
 
1153 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  24.41 
 
 
353 aa  47.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.65 
 
 
2449 aa  45.8  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  28.4 
 
 
1570 aa  45.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2521  cell wall anchor domain-containing protein  25.98 
 
 
987 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2573  cell wall anchor domain-containing protein  25.98 
 
 
987 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.63 
 
 
2397 aa  43.9  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
305 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>