More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2610 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  34.65 
 
 
199 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  32.29 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  35.71 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.81 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  32.31 
 
 
200 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.26 
 
 
457 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.53 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  29.35 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 
178 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  35.21 
 
 
209 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  35.94 
 
 
206 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  29.44 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  30.14 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  30.81 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  29 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  29.91 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  29.44 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  29.44 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.53 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  28.22 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  29.44 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  28.22 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  37.31 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  30.09 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  30.09 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.18 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  31.76 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  35.48 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 
197 aa  82  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  35.04 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.22 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  28.5 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.34 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  30.35 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  31.03 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  29.08 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.9 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  35.21 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  31.51 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  32.04 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.6 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  29.06 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  31.87 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  23.47 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  32.95 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  29.89 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.41 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.92 
 
 
521 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  28.86 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  29.27 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  27.43 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  33.74 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  28.29 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  28.25 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  35.44 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.75 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  28.37 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  28.67 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  26.99 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  25.63 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  30.56 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  28.16 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  28.65 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  28.65 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  28.09 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  28.65 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  32.2 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32.35 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  28.09 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  28.65 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  35.34 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  27.72 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.34 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  33.76 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  26.94 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  28.16 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.65 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  30.05 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  31.94 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  29.21 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  32.84 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.19 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>