More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1539 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 662 aa  1275    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  54.35 
 
 		 652 aa  675    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  50.68 
 
 		 673 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  51.12 
 
 		 671 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  38.91 
 
 		 667 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  38.37 
 
 		 762 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  35.24 
 
 		 666 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 		 674 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  33.54 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 773 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  42.01 
 
 		 567 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  42.73 
 
 		 567 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.37 
 
 		 567 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  37.24 
 
 		 665 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  36.07 
 
 		 775 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 		 771 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 658 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 		 672 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 665 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 665 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.14 
 
 		 697 aa  359  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  37.52 
 
 		 684 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 674 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 666 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 666 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  35.13 
 
 		 741 aa  332  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.27 
 
 		 682 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.85 
 
 		 670 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.38 
 
 		 665 aa  325  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.54 
 
 		 671 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  33.92 
 
 		 664 aa  319  9e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 636 aa  319  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  36.71 
 
 		 666 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 		 583 aa  310  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 		 565 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.62 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  36.62 
 
 		 668 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.38 
 
 		 664 aa  306  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  36.43 
 
 		 564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  36.62 
 
 		 568 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  36.5 
 
 		 556 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  38.76 
 
 		 624 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  36.38 
 
 		 566 aa  303  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 656 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 		 672 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 		 606 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  36.7 
 
 		 575 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  36.48 
 
 		 567 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 		 565 aa  296  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 659 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  36.45 
 
 		 555 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 674 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 		 605 aa  294  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 		 605 aa  294  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  30.8 
 
 		 676 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 		 693 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 		 678 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  35.48 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  39.55 
 
 		 607 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  38.61 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  37.45 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  30.48 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  32.3 
 
 		 649 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  32.21 
 
 		 648 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  32.21 
 
 		 648 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 		 584 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  33.48 
 
 		 668 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  37.38 
 
 		 567 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 657 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  32.21 
 
 		 648 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  36.25 
 
 		 564 aa  284  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  38.29 
 
 		 569 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.21 
 
 		 720 aa  283  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 		 572 aa  283  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  31.6 
 
 		 650 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 649 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 666 aa  282  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 		 667 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 		 667 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  38 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 		 567 aa  282  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  33.58 
 
 		 666 aa  282  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  35.62 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4122  sodium/hydrogen exchanger  38.59 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  34.35 
 
 		 563 aa  281  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 		 670 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 		 688 aa  280  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  34.23 
 
 		 661 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 		 661 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 668 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 668 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 668 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.94 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.85 
 
 		 655 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  32.06 
 
 		 648 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 		 670 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>