84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0714 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
315 aa  621  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  62.93 
 
 
319 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  62.11 
 
 
325 aa  364  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  62.42 
 
 
325 aa  359  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  59.88 
 
 
350 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  59.45 
 
 
326 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  61.85 
 
 
319 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  57.32 
 
 
314 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  53.87 
 
 
342 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  54.63 
 
 
338 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 
328 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  42.54 
 
 
318 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  41.27 
 
 
316 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
316 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 
465 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  40.63 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  40.63 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  41.27 
 
 
315 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
316 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
314 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  42.44 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  42.44 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  41.27 
 
 
316 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.27 
 
 
316 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.27 
 
 
316 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  38.41 
 
 
330 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  36.59 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  33.55 
 
 
347 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  37.89 
 
 
233 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  37.89 
 
 
233 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  46.91 
 
 
81 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  46.91 
 
 
81 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
409 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
394 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
394 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  34.78 
 
 
370 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  32.12 
 
 
404 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
394 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
414 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2479  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
347 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
394 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
394 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
394 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
379 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
689 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  29.09 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  36.27 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  34.65 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0283  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  34.62 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3087  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
383 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.69 
 
 
394 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
404 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.69 
 
 
394 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
393 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1801  glycosyltransferase  40.91 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  45.21 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  41.56 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
365 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2727  glycosyltransferase-like protein  31.75 
 
 
385 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.838383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  32.11 
 
 
381 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
363 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
362 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
409 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>