137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1947 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  100 
 
 
210 aa  399  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  99.05 
 
 
210 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  84.29 
 
 
210 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  53.33 
 
 
210 aa  200  1e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  48.11 
 
 
214 aa  184  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  55.5 
 
 
215 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  45.29 
 
 
237 aa  162  4e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  53.81 
 
 
220 aa  160  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  46.05 
 
 
288 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  42.53 
 
 
240 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  43.11 
 
 
240 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  42.2 
 
 
241 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  46.98 
 
 
223 aa  150  9e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  45.85 
 
 
224 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  45.98 
 
 
244 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  46.85 
 
 
309 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  45.98 
 
 
238 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  45.13 
 
 
225 aa  147  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  42.4 
 
 
228 aa  141  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  47.73 
 
 
250 aa  140  1e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  42.4 
 
 
232 aa  140  1e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  47.27 
 
 
239 aa  139  4e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  39.53 
 
 
228 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  42.59 
 
 
223 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  47.06 
 
 
229 aa  134  1e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  42.33 
 
 
223 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  41.63 
 
 
230 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  41.28 
 
 
231 aa  128  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  34.65 
 
 
231 aa  111  7e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  37.22 
 
 
223 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  37.26 
 
 
226 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  37.17 
 
 
230 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  37.39 
 
 
228 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  35.11 
 
 
230 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  36.44 
 
 
226 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  36.89 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  35.96 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  36.89 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  26.91 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  36.89 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  36.44 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  36 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  36 
 
 
226 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  34.19 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  35.81 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  29.09 
 
 
229 aa  84.3  1e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  33.93 
 
 
226 aa  81.3  1e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  30.91 
 
 
230 aa  80.9  1e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
226 aa  79.3  3e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
226 aa  79.3  3e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  33.04 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  35.35 
 
 
259 aa  78.6  6e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  32.57 
 
 
253 aa  78.2  8e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  31.78 
 
 
224 aa  77.8  1e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  32.62 
 
 
223 aa  77.4  1e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  29.72 
 
 
227 aa  77.4  1e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  34.38 
 
 
226 aa  77  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  30.05 
 
 
224 aa  77  2e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  28.17 
 
 
232 aa  77  2e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  32.91 
 
 
251 aa  75.9  4e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  31.91 
 
 
250 aa  75.5  5e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  30.99 
 
 
224 aa  75.1  7e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  31.16 
 
 
224 aa  74.7  9e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  28.02 
 
 
228 aa  74.3  1e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  26.55 
 
 
228 aa  73.2  3e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  31.28 
 
 
225 aa  73.2  3e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
240 aa  71.2  9e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  31.65 
 
 
224 aa  71.2  1e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  33.79 
 
 
224 aa  70.9  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  32.6 
 
 
226 aa  70.9  1e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  27.06 
 
 
221 aa  71.2  1e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  25.89 
 
 
229 aa  70.1  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  23.29 
 
 
228 aa  69.7  3e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  30.52 
 
 
224 aa  69.3  4e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  33.77 
 
 
238 aa  68.9  5e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  32.86 
 
 
223 aa  68.6  6e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  27.52 
 
 
227 aa  68.6  6e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  32.74 
 
 
223 aa  68.6  6e-11  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  28.63 
 
 
227 aa  68.6  7e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  24.07 
 
 
228 aa  68.2  8e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  29.02 
 
 
223 aa  68.2  8e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  29.77 
 
 
228 aa  68.2  8e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  33.75 
 
 
229 aa  67.8  1e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  32.73 
 
 
230 aa  66.6  2e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
229 aa  66.2  3e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  32.71 
 
 
223 aa  66.6  3e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
229 aa  66.2  3e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  23.74 
 
 
228 aa  65.9  4e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.08 
 
 
225 aa  65.9  5e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  30.67 
 
 
238 aa  65.5  5e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  26.58 
 
 
232 aa  65.5  6e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  31.12 
 
 
243 aa  65.5  6e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  28.7 
 
 
233 aa  64.7  1e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  29.02 
 
 
232 aa  63.9  1e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  30.22 
 
 
227 aa  64.7  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  27.19 
 
 
224 aa  63.9  2e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>