More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3956 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  94.76 
 
 		 229 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  94.32 
 
 		 229 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  73.45 
 
 		 234 aa  330  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  82.09 
 
 		 202 aa  324  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  75.88 
 
 		 234 aa  310  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  65.94 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  66.52 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  63.64 
 
 		 230 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  61.43 
 
 		 233 aa  272  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  61.95 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  64.68 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  61.47 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  63.29 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  61.47 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  62.9 
 
 		 227 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  64.81 
 
 		 231 aa  264  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  63.8 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  62.44 
 
 		 230 aa  261  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  62.44 
 
 		 260 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  58.48 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  58.48 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  62.73 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  62.96 
 
 		 247 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  62.5 
 
 		 251 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  58.7 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  61.32 
 
 		 217 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  65.58 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  62.04 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  61.47 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  60.7 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  58.45 
 
 		 252 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  62.5 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  57.14 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  55.2 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.3 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  60.5 
 
 		 258 aa  232  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  55.12 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  53.98 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  49.07 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  51.71 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  50.48 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  51.71 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  51.71 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  64.94 
 
 		 174 aa  215  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  50.67 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  50.48 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  52.51 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  52.97 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  52.94 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  52.51 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.88 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  54.11 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  52 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  52.51 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  55.41 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  53.21 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.78 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  52.53 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  51.5 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.66 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  51.5 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  51.5 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  52.53 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.66 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.66 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.66 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  54.37 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  52.83 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.66 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  48.54 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  52.04 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  49.1 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  54.68 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 219 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  47.17 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1277  ABC transporter related  57.53 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219395  normal  0.0718068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>