More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3050 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  65.6 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  60.8 
 
 		 125 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  61.86 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  60.66 
 
 		 125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  59.84 
 
 		 121 aa  146  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 121 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  57.76 
 
 		 123 aa  139  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32985  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0356565  hitchhiker  0.0000202177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2804  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0629199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  53.85 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  56.03 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  61.02 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4229  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.012135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  56.03 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  55 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1026  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.946369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0989  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>