More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3808 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 344 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 344 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  56.74 
 
 		 333 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  56.74 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  56.74 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  55.8 
 
 		 333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  57.62 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  55.49 
 
 		 333 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  55.17 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  56.75 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.49 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.17 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.17 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.17 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.17 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.17 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.86 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  45.76 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  45.68 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  36.2 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  36.99 
 
 		 499 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  39.11 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  36.22 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0456  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  38.84 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 		 528 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 924 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.11 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 335 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  30.71 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.11 
 
 		 754 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  32.1 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 477 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 236 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.83 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.59 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  34.5 
 
 		 792 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.2 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  30.77 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  26.52 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 1250 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 785 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 1077 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  30.8 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1217  general glycosylation pathway protein  29.91 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  31.32 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 753 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>