86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3178 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 85 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  96.47 
 
 		 85 aa  156  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  56.63 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  45.12 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  46.34 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  41.79 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0790  hythetical protein  45.33 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000412009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  38.96 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  42.86 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1993  hypothetical protein  39.44 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  37.84 
 
 		 197 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1998  hypothetical protein  39.44 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  43.33 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1981  protein of unknown function YGGT  39.06 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000863861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.49 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  35.14 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  37.84 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  35.14 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  31.43 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  37.84 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  39.19 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 		 196 aa  48.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  41.46 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  38.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  38.03 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  32.84 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  32.84 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  40 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  31.34 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  37.7 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  42.31 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  32.81 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  42.86 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  35.48 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  31.65 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  33.87 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  39.34 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  37.29 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  43.64 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  43.64 
 
 		 182 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  48.78 
 
 		 102 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 		 98 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  35.94 
 
 		 191 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  33.87 
 
 		 87 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  33.87 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  38.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  33.87 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  33.87 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  33.87 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  33.87 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  40.35 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  39.51 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  32.43 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  33.87 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  51.35 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  40.68 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  37.7 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  36.36 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>