More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2696 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
85 aa  172  1e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  1.36289e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  92.94 
 
 
85 aa  162  1e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 
88 aa  132  2e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  9.24332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  76.54 
 
 
86 aa  130  4e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 
91 aa  129  2e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  1.74741e-08 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  123  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.26179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.93871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
85 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.90958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
84 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
84 aa  117  8e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.60272e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  116  8e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
84 aa  116  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.53633e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
95 aa  116  1e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
92 aa  116  1e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
89 aa  115  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  115  2e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.40306e-15  unclonable  7.87501e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  114  4e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  114  4e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
93 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
84 aa  112  1e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
84 aa  113  1e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
91 aa  112  2e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
88 aa  111  4e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  63.86 
 
 
95 aa  110  4e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.69897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
84 aa  110  7e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  64.63 
 
 
93 aa  110  8e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
84 aa  110  8e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 
90 aa  109  2e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.67607e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 
90 aa  109  2e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  2.49957e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
94 aa  108  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
90 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 
85 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 
88 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
87 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
85 aa  107  8e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
95 aa  107  8e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.81623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
90 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  56.47 
 
 
91 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
85 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
84 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
98 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.56783e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
88 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.01837e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
85 aa  104  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
83 aa  104  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.79495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
85 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
86 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  3.40822e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
88 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  62.35 
 
 
92 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.54683e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
89 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  60 
 
 
87 aa  103  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 
85 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.11893e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 
88 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 
87 aa  103  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 
85 aa  103  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  65.71 
 
 
85 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  63.1 
 
 
85 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.26464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
86 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
97 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.33239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
98 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.63692e-08  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
92 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
85 aa  103  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
92 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  57.47 
 
 
88 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  61.04 
 
 
89 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 
89 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 
88 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 
85 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 
88 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
86 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  65.71 
 
 
85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
82 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
86 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  65.71 
 
 
85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
85 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  68.57 
 
 
84 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  61.04 
 
 
88 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 
89 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 
89 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 
91 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
89 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.60226e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.11721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.53229e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>