More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0741 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
172 aa  348  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  87.79 
 
 
172 aa  320  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  72.78 
 
 
173 aa  261  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
172 aa  236  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  56.36 
 
 
173 aa  201  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
172 aa  193  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
172 aa  193  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
171 aa  191  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
174 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
171 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
172 aa  186  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
172 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
174 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
171 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
171 aa  184  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  54.82 
 
 
176 aa  184  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
168 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
172 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
172 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
177 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
170 aa  180  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  179  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
170 aa  179  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
173 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  177  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
172 aa  177  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
170 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
172 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
180 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
171 aa  175  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
172 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
424 aa  175  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
172 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
170 aa  175  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
174 aa  175  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  174  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
175 aa  174  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  174  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
185 aa  174  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
176 aa  174  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
172 aa  171  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
182 aa  170  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3739  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
176 aa  170  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0293809  normal  0.608797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
172 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
184 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
170 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
170 aa  168  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  168  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
173 aa  168  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
197 aa  167  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1819  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
170 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0215427  normal  0.463714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
177 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
182 aa  167  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
182 aa  167  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
177 aa  167  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
171 aa  167  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
205 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
177 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
181 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
175 aa  165  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
172 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
173 aa  165  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  49.37 
 
 
175 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
172 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
172 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
181 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>