More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5039 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1406  acetolactate synthase, large subunit  58.44 
 
 
563 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0875131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  100 
 
 
611 aa  1243    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  76.73 
 
 
565 aa  894    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  78.37 
 
 
564 aa  909    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1253  putative acetolactate synthase large subunit  38.79 
 
 
595 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713143  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4081  thiamine pyrophosphate protein central region  39.05 
 
 
583 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721438  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5588  thiamine pyrophosphate protein central region  38.11 
 
 
583 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1037  acetolactate synthase, large subunit  38.08 
 
 
551 aa  371  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0844069  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2846  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.48 
 
 
574 aa  339  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  35.07 
 
 
599 aa  323  6e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  33.81 
 
 
587 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.81 
 
 
587 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  33.63 
 
 
587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  33.81 
 
 
587 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.91 
 
 
588 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2284  acetolactate synthase catalytic subunit  34.95 
 
 
575 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.774039  hitchhiker  0.0072458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.73 
 
 
542 aa  287  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.83 
 
 
566 aa  286  5e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  32.98 
 
 
577 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0336  acetolactate synthase catalytic subunit  36.16 
 
 
575 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.58 
 
 
557 aa  281  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.23 
 
 
557 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3747  acetolactate synthase catalytic subunit  34.97 
 
 
581 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  32.12 
 
 
567 aa  280  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.42 
 
 
557 aa  277  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.73 
 
 
555 aa  277  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.95 
 
 
552 aa  276  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.22 
 
 
569 aa  276  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.2 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 
559 aa  272  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  31.65 
 
 
542 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.6 
 
 
563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.45 
 
 
563 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  31.32 
 
 
555 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.36 
 
 
563 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.03 
 
 
563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.29 
 
 
558 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.31 
 
 
535 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.45 
 
 
573 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 
568 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.8 
 
 
561 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  33.09 
 
 
581 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.3 
 
 
569 aa  265  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.68 
 
 
562 aa  264  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.73 
 
 
574 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.32 
 
 
566 aa  263  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.92 
 
 
581 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.74 
 
 
572 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.45 
 
 
553 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.56 
 
 
581 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.39 
 
 
559 aa  262  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.92 
 
 
555 aa  262  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.36 
 
 
586 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.24 
 
 
588 aa  260  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.2 
 
 
572 aa  259  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.23 
 
 
552 aa  259  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.73 
 
 
569 aa  259  9e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.55 
 
 
584 aa  259  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.2 
 
 
572 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.1 
 
 
572 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.38 
 
 
569 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.68 
 
 
573 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.75 
 
 
570 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.2 
 
 
572 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.91 
 
 
572 aa  257  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  31.73 
 
 
569 aa  257  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.67 
 
 
563 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.16 
 
 
573 aa  257  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.2 
 
 
572 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  32.19 
 
 
574 aa  256  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.02 
 
 
573 aa  256  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.09 
 
 
581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  30.33 
 
 
566 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.92 
 
 
584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.1 
 
 
584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.21 
 
 
636 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.68 
 
 
612 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.09 
 
 
581 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.5 
 
 
572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.56 
 
 
561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  31.76 
 
 
562 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.79 
 
 
573 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.07 
 
 
573 aa  254  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.02 
 
 
572 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.02 
 
 
572 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.1 
 
 
584 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.02 
 
 
572 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  30.13 
 
 
550 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3419  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30 
 
 
579 aa  253  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130634  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  30.11 
 
 
577 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.32 
 
 
582 aa  252  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.6 
 
 
584 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30 
 
 
587 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.02 
 
 
572 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.54 
 
 
564 aa  253  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.73 
 
 
584 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.64 
 
 
558 aa  252  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.63 
 
 
565 aa  252  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.13 
 
 
572 aa  252  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.26 
 
 
574 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>