More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2206 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  81.58 
 
 
266 aa  444  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  68.66 
 
 
284 aa  346  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  69.29 
 
 
279 aa  339  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  69.4 
 
 
279 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.68 
 
 
263 aa  301  7e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.68 
 
 
267 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.14 
 
 
273 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.43e-05  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.8 
 
 
263 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.23 
 
 
259 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.81 
 
 
257 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.93 
 
 
269 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.14 
 
 
273 aa  273  2e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.14 
 
 
273 aa  273  2e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.46 
 
 
268 aa  272  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  1.56624e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.78 
 
 
273 aa  271  8e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.39023e-06  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
268 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  5.89518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.79 
 
 
260 aa  269  3e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  2.29771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.23 
 
 
258 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.84 
 
 
268 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.81 
 
 
263 aa  265  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.72 
 
 
268 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.72 
 
 
268 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  56.72 
 
 
268 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.72 
 
 
268 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.72 
 
 
268 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.56 
 
 
256 aa  264  9e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.26 
 
 
257 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.26 
 
 
257 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.72 
 
 
259 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  52.26 
 
 
252 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  47.92 
 
 
265 aa  258  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.3 
 
 
257 aa  257  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1498  metallo-beta-lactamase family protein  56.72 
 
 
268 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.950921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1602  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.72 
 
 
268 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.56 
 
 
258 aa  254  1e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.59 
 
 
259 aa  254  1e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.77 
 
 
259 aa  254  1e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.94 
 
 
245 aa  254  1e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.69 
 
 
257 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.87 
 
 
252 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.23 
 
 
264 aa  245  5e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.87 
 
 
252 aa  244  1e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.19 
 
 
259 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  49.46 
 
 
265 aa  242  4e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.96 
 
 
259 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0843  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.7 
 
 
223 aa  241  8e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.55491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.19 
 
 
259 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.19 
 
 
259 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.56 
 
 
259 aa  238  7e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  46.52 
 
 
267 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  9.87439e-07  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.15 
 
 
263 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.11011e-06  hitchhiker  9.70016e-05 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 
240 aa  234  1e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.7 
 
 
258 aa  233  2e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  47.74 
 
 
252 aa  233  2e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.89 
 
 
295 aa  233  2e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.53605e-09  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.79 
 
 
263 aa  234  2e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.79 
 
 
263 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.46784e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.89 
 
 
295 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  46.89 
 
 
267 aa  232  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.69 
 
 
267 aa  231  7e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.49519e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.38 
 
 
256 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.81 
 
 
259 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.42 
 
 
256 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.15 
 
 
263 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.34001e-07  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.72 
 
 
259 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.66 
 
 
258 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  3.60558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.01 
 
 
258 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.96006e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.85 
 
 
251 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.65 
 
 
263 aa  225  5e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.58 
 
 
257 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.3 
 
 
259 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.69 
 
 
251 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.81 
 
 
260 aa  220  1e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  50.19 
 
 
255 aa  218  8e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.53 
 
 
250 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.05 
 
 
250 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.31 
 
 
255 aa  216  3e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.49 
 
 
266 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.79 
 
 
256 aa  215  6e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 
280 aa  215  6e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.89 
 
 
257 aa  214  1e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  43.89 
 
 
257 aa  214  1e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  42.26 
 
 
251 aa  214  2e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
251 aa  214  2e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.32 
 
 
272 aa  214  2e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.15 
 
 
263 aa  213  4e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
251 aa  212  5e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.84 
 
 
258 aa  212  6e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2023  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  41.48 
 
 
272 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.035602  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.64 
 
 
263 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.62 
 
 
255 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.7 
 
 
258 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.7 
 
 
258 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.27 
 
 
256 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.82 
 
 
259 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.769751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.61 
 
 
263 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.39632e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  38.58 
 
 
254 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.2 
 
 
259 aa  202  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.22 
 
 
258 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>