142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0097 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  67.4 
 
 		 260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0286  hypothetical protein  61.76 
 
 		 238 aa  251  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.407695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  60.85 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0144  Sporulation domain protein  60.85 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  43.26 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  41.16 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  39.61 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  39.61 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  39.67 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  39.67 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  39.67 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  39.67 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  39.67 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  41.26 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0415  sporulation domain-containing protein  37.77 
 
 		 218 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0774  sporulation related  35.44 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0333  Sporulation domain protein  36.13 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.68871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0344  sporulation domain-containing protein  37.55 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0670  sporulation domain-containing protein  38.75 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0574  sporulation domain-containing protein  32.17 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  57.83 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  58.54 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  58.54 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  58.54 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  58.54 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  58.54 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  58.54 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  58.54 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4489  sporulation related  33.89 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  34.5 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  32.92 
 
 		 202 aa  85.5  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0152  hypothetical protein  34.31 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0462  Sporulation domain protein  46.67 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3865  sporulation related  29.78 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4229  sporulation domain-containing protein  32.2 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  50 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  36.11 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  35.06 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  40.28 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  37.66 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0398  sporulation-like  27.63 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2674  sporulation related  31.58 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  27.95 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  27.95 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2773  sporulation domain-containing protein  41.1 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  28.38 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  42.25 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3702  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  36.99 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  45.83 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  41.33 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  25.99 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66760  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  35.44 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  37.66 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  42.47 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5789  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  42.47 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  42.47 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  42.47 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  41.1 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  30.67 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  38.81 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  33.02 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  40.91 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0026  hypothetical protein  32.43 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  40.28 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  40.91 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  38.67 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0601  sporulation related  27.39 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  28.79 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  38 
 
 		 176 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  38.03 
 
 		 176 aa  52  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  33.71 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  37.66 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  31.34 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  31.94 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  30.71 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  26.88 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  31.25 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  31.25 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  31.25 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  30.56 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1908  sporulation related  31.51 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  35.9 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  30 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  31.87 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  28.99 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  34.25 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  28.99 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  28.99 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2238  hypothetical protein  34.25 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  28.7 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  28.57 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>