142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0070 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  71.88 
 
 		 313 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  53.82 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  51.91 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  52.87 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  44.69 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.41 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  42.49 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  42.17 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  42.17 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  42.17 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  41.85 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  41.85 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  43.23 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  44.88 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  41.89 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  35.56 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  33.53 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  33.53 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  33.23 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  33.44 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  32.38 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  33.02 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  31.9 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  33.23 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  28.18 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  29.8 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  29.8 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  29.05 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.36 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  28.47 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  29.39 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.75 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  28.4 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  26.14 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  25.98 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  25.81 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  25.64 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  25.56 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  26.5 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.94 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  26.67 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.6 
 
 		 579 aa  89  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  25.94 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  27.48 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.36 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.15 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.28 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  26.59 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  24.46 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.93 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.65 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  25.16 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  24.92 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  25.16 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  24.62 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  24.45 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  24.5 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  22.37 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.37 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  23.96 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  26.67 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  24.39 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  23.05 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.53 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  26.98 
 
 		 433 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  25.85 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  24.05 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  27.98 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  23.64 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  28.02 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  24.27 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  23.68 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  23.05 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  23.38 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  24.55 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  25.32 
 
 		 455 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  27.64 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  24.85 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  25.54 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.93 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  29.41 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  25.5 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  22.74 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  25.07 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  24.46 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  24.24 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  26.05 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  26.03 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  20 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  26.38 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>