More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1499 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00711  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase) (Acyl-activating enzyme)  63.06 
 
 
648 aa  857  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2952  acetyl-CoA synthetase  67.55 
 
 
649 aa  916  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
660 aa  637  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2725  acetyl-CoA synthetase  64.86 
 
 
650 aa  871  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.469585  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5598  acetyl-CoA synthetase  66 
 
 
648 aa  902  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3776  acetyl-CoA synthetase  66.29 
 
 
653 aa  878  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.800941  hitchhiker  0.000764225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0731  acetyl-CoA synthetase  63.98 
 
 
644 aa  881  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40572  hitchhiker  9.26567e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  62.38 
 
 
652 aa  848  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  62.38 
 
 
652 aa  848  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  64.42 
 
 
652 aa  871  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0111  acetyl-CoA synthetase  64.91 
 
 
646 aa  863  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865041  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  66.13 
 
 
644 aa  895  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3992  acetyl-CoA synthetase  65.97 
 
 
653 aa  875  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733733  normal  0.105895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  67.91 
 
 
649 aa  917  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  64.42 
 
 
652 aa  871  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 
660 aa  637  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1451  acetyl-CoA synthetase  66.03 
 
 
647 aa  866  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
664 aa  640  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4528  acetyl-CoA synthetase  62.54 
 
 
652 aa  842  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855103  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  62.7 
 
 
652 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  62.7 
 
 
652 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3974  acetyl-CoA synthetase  65.79 
 
 
647 aa  879  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162382  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  50.71 
 
 
667 aa  673  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  51.26 
 
 
664 aa  684  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0209  acetyl-CoA synthetase  68.12 
 
 
650 aa  929  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237661  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  50.94 
 
 
663 aa  649  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.65 
 
 
657 aa  691  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2494  acetyl-CoA synthetase  67.29 
 
 
649 aa  911  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03257  acetyl-CoA synthetase  66.51 
 
 
647 aa  880  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  52.16 
 
 
660 aa  644  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0053  acetyl-CoA synthetase  68.87 
 
 
645 aa  922  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1381  acetyl-CoA synthetase  65.23 
 
 
647 aa  855  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.319364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  54.79 
 
 
649 aa  694  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  65.34 
 
 
650 aa  880  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  55.11 
 
 
658 aa  700  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  51.04 
 
 
653 aa  644  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  67.65 
 
 
651 aa  920  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  65.34 
 
 
650 aa  882  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  52.55 
 
 
654 aa  640  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  68.44 
 
 
645 aa  924  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  64.26 
 
 
651 aa  868  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  63.54 
 
 
652 aa  838  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  67.45 
 
 
649 aa  904  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  59.47 
 
 
651 aa  793  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  49.69 
 
 
639 aa  656  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  54.25 
 
 
650 aa  664  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  66.29 
 
 
644 aa  894  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  65.97 
 
 
653 aa  876  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  65.83 
 
 
645 aa  886  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  63.89 
 
 
651 aa  852  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  68.06 
 
 
651 aa  924  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  52.05 
 
 
631 aa  654  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  50.77 
 
 
657 aa  647  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  63.28 
 
 
658 aa  844  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  63.1 
 
 
653 aa  847  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  59.91 
 
 
654 aa  794  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  64.55 
 
 
650 aa  884  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  64.48 
 
 
652 aa  861  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  64.71 
 
 
650 aa  870  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  62.38 
 
 
652 aa  848  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  62.38 
 
 
652 aa  848  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01635  acetyl-CoA synthase  61.26 
 
 
653 aa  821  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  64.11 
 
 
682 aa  857  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  54.74 
 
 
650 aa  667  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  49.23 
 
 
639 aa  650  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  67.34 
 
 
651 aa  913  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  70.45 
 
 
647 aa  968  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  1.84836e-11 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  64.42 
 
 
652 aa  872  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  69.05 
 
 
650 aa  919  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  52.21 
 
 
632 aa  660  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  55.81 
 
 
656 aa  713  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6139  acetate/CoA ligase  55.59 
 
 
660 aa  719  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  56.09 
 
 
649 aa  739  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  55.52 
 
 
650 aa  688  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0914  acetyl-CoA synthetase  63.54 
 
 
653 aa  862  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  55.95 
 
 
656 aa  694  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  53.16 
 
 
655 aa  644  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  59.35 
 
 
661 aa  743  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  8.82017e-06  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  56.03 
 
 
649 aa  689  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  54.93 
 
 
663 aa  746  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  52.15 
 
 
680 aa  643  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  57.12 
 
 
657 aa  765  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  51.72 
 
 
658 aa  647  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  56.21 
 
 
664 aa  714  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 
663 aa  651  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0917  acetate/CoA ligase  55.84 
 
 
637 aa  715  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002199  acetyl-coenzyme A synthetase  64.59 
 
 
650 aa  860  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  100 
 
 
661 aa  1363  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03255  acetyl-CoA synthetase  54.91 
 
 
635 aa  719  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  59.15 
 
 
651 aa  745  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  54.03 
 
 
659 aa  642  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  53.82 
 
 
652 aa  723  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  50.87 
 
 
655 aa  650  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  60.56 
 
 
648 aa  780  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  51.37 
 
 
652 aa  645  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  51.67 
 
 
649 aa  660  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  52.5 
 
 
665 aa  645  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2894  acetate/CoA ligase  56.08 
 
 
631 aa  735  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2042  acetate/CoA ligase  56.89 
 
 
636 aa  732  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155231  normal  0.184669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  52.42 
 
 
661 aa  637  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>