More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6006 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  100 
 
 
219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  92.02 
 
 
188 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  69.89 
 
 
186 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  69.35 
 
 
186 aa  268  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  68.82 
 
 
186 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  67.74 
 
 
186 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  68.28 
 
 
186 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  66.13 
 
 
186 aa  257  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  70.43 
 
 
186 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  77.22 
 
 
186 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  64.52 
 
 
196 aa  247  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  62.77 
 
 
188 aa  239  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  61.29 
 
 
186 aa  237  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  67.95 
 
 
186 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  49.73 
 
 
210 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  53.23 
 
 
187 aa  203  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  50.81 
 
 
211 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  53.05 
 
 
211 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  42.47 
 
 
185 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  42.47 
 
 
185 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5447  exopolysaccharide production protein ExoY  56.92 
 
 
134 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.09 
 
 
208 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  45.16 
 
 
230 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1433  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  42.24 
 
 
194 aa  141  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.48 
 
 
199 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  44.97 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.39 
 
 
207 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.54 
 
 
473 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3389  sugar transferase  43.55 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.251832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  42.39 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2483  sugar transferase  42.25 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  39.11 
 
 
188 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08350  glycosyl transferase possibly involved in lipopolysaccharide synthesis  38.22 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.163172  normal  0.229141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  42.31 
 
 
189 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  42.25 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.93 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.24 
 
 
490 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  37.62 
 
 
214 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.33 
 
 
204 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2699  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.62 
 
 
477 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  44.97 
 
 
206 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.08 
 
 
471 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2005  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  39.39 
 
 
649 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.38 
 
 
456 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  41.76 
 
 
484 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  39.52 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  41.34 
 
 
451 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.7 
 
 
346 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.85 
 
 
496 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.04 
 
 
457 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1395  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.02 
 
 
470 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  41.71 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1951  sugar transferase  41.45 
 
 
472 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  0.0120821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  44.08 
 
 
185 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  40.88 
 
 
182 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.22 
 
 
219 aa  124  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.55 
 
 
464 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1255  galactosyltransferase  44.44 
 
 
200 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  38.38 
 
 
202 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  42.11 
 
 
490 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  45.55 
 
 
464 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02342  glycosyl transferase transmembrane protein  46.5 
 
 
203 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.55 
 
 
464 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.55 
 
 
464 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  42.29 
 
 
183 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  45.55 
 
 
464 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.46 
 
 
468 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.98 
 
 
518 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2023  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.32 
 
 
201 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  hitchhiker  0.0000000000460797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.55 
 
 
464 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.55 
 
 
464 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  43.21 
 
 
182 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.98 
 
 
536 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0597  general glycosylation pathway protein  41.05 
 
 
200 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  40.86 
 
 
484 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1539  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.58 
 
 
506 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.03 
 
 
464 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.39 
 
 
512 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0489  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.32 
 
 
243 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90918  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.08 
 
 
454 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.39 
 
 
506 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.54 
 
 
466 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.78 
 
 
506 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.34 
 
 
477 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.29 
 
 
501 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  39.47 
 
 
200 aa  121  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  42.02 
 
 
464 aa  121  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.3 
 
 
471 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.98 
 
 
517 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1345  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.09 
 
 
206 aa  121  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.940885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  42.16 
 
 
598 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.94 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.04 
 
 
463 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  44.83 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.64 
 
 
521 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.68 
 
 
464 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  39.47 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  42.16 
 
 
460 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2444  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.12 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145339  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0111  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.46 
 
 
477 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.629672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>