More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2718 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
344 aa  700  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  82.34 
 
 
351 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  61.11 
 
 
347 aa  407  1e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  54.6 
 
 
334 aa  358  1e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  54.6 
 
 
334 aa  358  1e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  53.82 
 
 
346 aa  356  3e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  57.51 
 
 
308 aa  353  3e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  57.43 
 
 
303 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  46.01 
 
 
332 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  36.71 
 
 
371 aa  256  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  42.3 
 
 
362 aa  254  2e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  41.93 
 
 
356 aa  252  8e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  45.6 
 
 
329 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  40.2 
 
 
313 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.3 
 
 
340 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  36.92 
 
 
309 aa  221  2e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.85 
 
 
310 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  38.21 
 
 
313 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.85 
 
 
352 aa  213  5e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  37.35 
 
 
369 aa  212  6e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.54 
 
 
310 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.54 
 
 
310 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.54 
 
 
310 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.65105e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.56 
 
 
339 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.54 
 
 
310 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  38.54 
 
 
310 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  38.54 
 
 
328 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.35054e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.34 
 
 
310 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.13 
 
 
318 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.30529e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.85 
 
 
314 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.24 
 
 
339 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.79 
 
 
318 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.51275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  36.9 
 
 
307 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.85 
 
 
314 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.85 
 
 
314 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.85 
 
 
314 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.85 
 
 
314 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  37.22 
 
 
297 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  35.69 
 
 
307 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.81 
 
 
321 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  6.94266e-06  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.62 
 
 
340 aa  201  1e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  36.95 
 
 
334 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  35.87 
 
 
302 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  35.56 
 
 
302 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  37.87 
 
 
311 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  34.45 
 
 
302 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  35.41 
 
 
295 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  35.18 
 
 
326 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  33.15 
 
 
378 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.07 
 
 
314 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  34.6 
 
 
318 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  34.38 
 
 
297 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  34.43 
 
 
293 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  36.66 
 
 
336 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  36 
 
 
345 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  35.51 
 
 
347 aa  167  3e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.7 
 
 
282 aa  163  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.07 
 
 
297 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 
287 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  43.11 
 
 
328 aa  153  3e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 
321 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  30.59 
 
 
301 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  31.89 
 
 
293 aa  141  1e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  31.55 
 
 
310 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 
368 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.09 
 
 
372 aa  122  1e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
314 aa  120  4e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  30 
 
 
344 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.4 
 
 
312 aa  115  2e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 
365 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 
339 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 
328 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.88581e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.34 
 
 
322 aa  109  9e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  29.74 
 
 
292 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 
321 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.91 
 
 
309 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 
311 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 
317 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.75 
 
 
316 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 
309 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  26.25 
 
 
358 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 
295 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  28.91 
 
 
316 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.03 
 
 
316 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 
285 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 
333 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.45 
 
 
316 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.15 
 
 
316 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  30.52 
 
 
316 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.63 
 
 
345 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.15 
 
 
316 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.86 
 
 
316 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.82 
 
 
316 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.64 
 
 
294 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 
346 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  29.45 
 
 
316 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  31.18 
 
 
265 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  27.89 
 
 
324 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
304 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>