25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1105 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  100 
 
 
499 aa  987    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  90.98 
 
 
499 aa  906    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  59.6 
 
 
497 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  58.32 
 
 
496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  44.89 
 
 
495 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  44.06 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  42.74 
 
 
493 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  40.53 
 
 
508 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  40.04 
 
 
497 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
483 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  29.32 
 
 
505 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  29.54 
 
 
505 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  25.36 
 
 
506 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  34.09 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  30.2 
 
 
528 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  27.65 
 
 
513 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
526 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
636 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  28.22 
 
 
512 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  25.88 
 
 
513 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.42 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  28.92 
 
 
812 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  26.21 
 
 
597 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  22.27 
 
 
610 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>