63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5579 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  90.4 
 
 
453 aa  826    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  34.64 
 
 
466 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  36.09 
 
 
471 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 
455 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  32.97 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  35.57 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  33.7 
 
 
469 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  32.75 
 
 
445 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  33.48 
 
 
469 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.84 
 
 
475 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  32.82 
 
 
442 aa  206  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  31.98 
 
 
473 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  33.48 
 
 
474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.92 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  32.39 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.22 
 
 
460 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
445 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  31.83 
 
 
470 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  31.91 
 
 
467 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  33.18 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.48 
 
 
479 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  32.03 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  31.24 
 
 
466 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  31.24 
 
 
466 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  31.24 
 
 
466 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  31.24 
 
 
466 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  31.24 
 
 
466 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.82 
 
 
883 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  31.78 
 
 
471 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  31.29 
 
 
470 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  31.02 
 
 
466 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  30.7 
 
 
444 aa  179  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.24 
 
 
460 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.24 
 
 
460 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  31.1 
 
 
474 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  29.78 
 
 
473 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.2 
 
 
481 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.43 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 
455 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
485 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  28.51 
 
 
454 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  33.63 
 
 
1751 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
480 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.27 
 
 
468 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.94 
 
 
482 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  30.24 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
478 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29 
 
 
499 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.68 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  25.11 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  24.67 
 
 
468 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  27.38 
 
 
458 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.41 
 
 
506 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  27.37 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  28.87 
 
 
507 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  31.16 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  39.53 
 
 
239 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.86 
 
 
608 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  27.84 
 
 
125 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  24.56 
 
 
533 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.729599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>