74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4068 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  96.54 
 
 		 230 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  73.81 
 
 		 231 aa  315  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  69.34 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  60 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  58.97 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  58.16 
 
 		 217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  53.33 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  43.63 
 
 		 264 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  44.85 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  43.14 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  41.67 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  42 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  39.59 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  39.49 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  37.7 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  36.6 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  39.32 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  38.86 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  38.86 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  40.93 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  38.34 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  42.11 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  37.93 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  37.71 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  38.97 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  36.59 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  36.41 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  32 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  38.31 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  31.77 
 
 		 194 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  31.5 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  28.88 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  35.23 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  34.09 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  34.09 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  34.54 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  30.21 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  31.33 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  31.52 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  33.5 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  30.41 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  30.57 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  30.72 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  28.99 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  26.82 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.5 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  28.36 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  39.24 
 
 		 92 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  39.39 
 
 		 110 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  36.36 
 
 		 140 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2313  hypothetical protein  34.88 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13241  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1415  hypothetical protein  36.51 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00199803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  34.29 
 
 		 139 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.68 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  32.1 
 
 		 90 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  35 
 
 		 96 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  29.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  32.31 
 
 		 93 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  29.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  28.89 
 
 		 101 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  37.88 
 
 		 110 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  32.53 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  32.18 
 
 		 120 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  35.94 
 
 		 79 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  28.77 
 
 		 93 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  32.1 
 
 		 524 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  30.14 
 
 		 90 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  30.56 
 
 		 107 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  30.77 
 
 		 96 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>