More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3197 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3197  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
492 aa  983    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3492  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  72.42 
 
 
491 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0309662  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3626  hypothetical protein  38.72 
 
 
454 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.85 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3168  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.41 
 
 
446 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1692  hypothetical protein  32.7 
 
 
448 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1636  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.49 
 
 
448 aa  154  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1222  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.14 
 
 
456 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.44 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  43.01 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  42.63 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  41.27 
 
 
430 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2319  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.5 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.074868  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2413  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.14 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.78 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378443  normal  0.301003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.59 
 
 
368 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0689  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.86 
 
 
409 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0666  cell cycle protein  35.61 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1316  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.26 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.1 
 
 
345 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3637  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.79 
 
 
400 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.845838  normal  0.200954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4744  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  42 
 
 
346 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.68 
 
 
342 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.68 
 
 
347 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  38.75 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0978  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  39.6 
 
 
422 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0172584  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0779  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.71 
 
 
377 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0526339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.44 
 
 
342 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.27 
 
 
433 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6875  tRNA(Ile)-lysidine synthase  42.93 
 
 
358 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487527  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0365  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.93 
 
 
390 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.34 
 
 
524 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4142  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  42.5 
 
 
347 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0565  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.05 
 
 
412 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0878  cell cycle protein MesJ  24.81 
 
 
433 aa  101  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  34.96 
 
 
431 aa  100  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1097  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.87 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5490  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.37 
 
 
339 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0282  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.43 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271533  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4424  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.84 
 
 
455 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  44.81 
 
 
284 aa  97.1  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1620  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.11 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  31.94 
 
 
357 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0167  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.06 
 
 
660 aa  94.7  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1817  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  41.87 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19753  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.16 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0544  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000216418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.05 
 
 
241 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0531  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00156827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.1 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.16 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0934  cell-cycle protein  33.69 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.504247  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.89 
 
 
464 aa  86.7  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.78 
 
 
423 aa  86.7  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  32.8 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.16 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.05 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1097  PP-loop protein  38.64 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.873661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.47 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.4 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.4 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31371  predicted protein  28.5 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.5 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.934648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  36.36 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  36.26 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.44 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.86 
 
 
325 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
682 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1341  hypothetical protein  29.95 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.22 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00012547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.46 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.83 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  37.5 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.78 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  30.52 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.55 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.62 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.53 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0437  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.83 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203685  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.75 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0402  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  30.73 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.82 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  29.06 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.2 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  29.06 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.45 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.43 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.763713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.98 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1088  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  37.95 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00200666  normal  0.0296865 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  32.98 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0148  MesJ/Ycf62 family protein  30.69 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  33.17 
 
 
445 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  36.22 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.17 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0255  PP-loop family protein  32.46 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.765354  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.84 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.51 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.9 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0275  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  30 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.538522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.16 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>