More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2188 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  100 
 
 
266 aa  540  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  86.42 
 
 
269 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  70.19 
 
 
273 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  50.96 
 
 
270 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  36.88 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  37.88 
 
 
268 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  37.55 
 
 
264 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  36.82 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  38.08 
 
 
248 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  35.02 
 
 
272 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  39.92 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  38.25 
 
 
274 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
248 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
248 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  40 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  35.91 
 
 
248 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  36.4 
 
 
267 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  37.16 
 
 
252 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
267 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  39.16 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  36.93 
 
 
266 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
262 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.21 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  34.19 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
225 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.67 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  43.36 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.74 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  39.47 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.44 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.44 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  31.5 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.36 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  35 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.61 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.59 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  43.62 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  34 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.74 
 
 
213 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  34 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.45 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  34 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  34 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  34 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  34 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  34 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  32.41 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  34.34 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  34 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.71 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  34 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  28.81 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  28.71 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
282 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>