More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2763 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
307 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  91.21 
 
 
307 aa  593  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  86.51 
 
 
308 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  86.18 
 
 
308 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  85.2 
 
 
308 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  78.43 
 
 
309 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  77.78 
 
 
309 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  77.45 
 
 
309 aa  507  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  77.74 
 
 
326 aa  505  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  77.41 
 
 
326 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  77.12 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  77.12 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  77.12 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  77.12 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  77.12 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  77.12 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  77.12 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  76.8 
 
 
309 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  76.14 
 
 
309 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  75.49 
 
 
309 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  75.82 
 
 
309 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  75.82 
 
 
309 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  75.82 
 
 
309 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  75.16 
 
 
309 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  74.84 
 
 
560 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  70.82 
 
 
329 aa  467  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  70.96 
 
 
309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  70.72 
 
 
308 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  71.1 
 
 
305 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 
310 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  70.13 
 
 
309 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  71.71 
 
 
305 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  71.71 
 
 
305 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  69.71 
 
 
311 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  71.1 
 
 
306 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  71.1 
 
 
302 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  68.57 
 
 
320 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  69.77 
 
 
306 aa  448  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  67.85 
 
 
320 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  70.72 
 
 
306 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  66.78 
 
 
329 aa  431  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 
302 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  58.67 
 
 
300 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  57.91 
 
 
303 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 
311 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 
311 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  58.39 
 
 
300 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 
304 aa  351  7e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  55.67 
 
 
304 aa  348  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.69 
 
 
321 aa  345  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  56.9 
 
 
298 aa  345  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 
306 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 
305 aa  343  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  56.38 
 
 
301 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  53.69 
 
 
306 aa  342  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  53.69 
 
 
307 aa  340  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
305 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  54.88 
 
 
306 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 
312 aa  338  7e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  54.82 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 
304 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 
305 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 
308 aa  333  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  53.54 
 
 
307 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 
305 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  54.36 
 
 
306 aa  329  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
305 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 
306 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
303 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  52.86 
 
 
306 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 
306 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 
306 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
305 aa  319  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
303 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.94 
 
 
309 aa  315  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 
303 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
303 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
355 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
308 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
307 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
302 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
316 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
308 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
309 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  47.27 
 
 
312 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
308 aa  288  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
303 aa  288  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
303 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
308 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
309 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 
311 aa  286  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
313 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
328 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 
311 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>