269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0815 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  83.02 
 
 
212 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  70.75 
 
 
212 aa  316  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  70.75 
 
 
212 aa  312  2e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  69.34 
 
 
212 aa  307  1e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  68.22 
 
 
214 aa  306  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.29 
 
 
214 aa  303  1e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.29 
 
 
214 aa  303  2e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.29 
 
 
214 aa  303  2e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.29 
 
 
214 aa  301  4e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.76 
 
 
214 aa  301  5e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  67.76 
 
 
214 aa  301  5e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.09 
 
 
212 aa  299  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  2.3808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
214 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
214 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
214 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.95 
 
 
265 aa  295  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  9.6585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.89 
 
 
214 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.79 
 
 
213 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.32 
 
 
213 aa  288  5e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.03 
 
 
211 aa  278  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60 
 
 
214 aa  271  8e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.66 
 
 
215 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.14 
 
 
215 aa  267  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.72 
 
 
224 aa  265  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.38 
 
 
211 aa  261  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.82 
 
 
215 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.95 
 
 
211 aa  260  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.04 
 
 
215 aa  258  5e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.57 
 
 
215 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.29 
 
 
225 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.75 
 
 
213 aa  254  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
211 aa  254  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.81 
 
 
212 aa  254  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.08 
 
 
239 aa  253  1e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.19 
 
 
211 aa  252  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.94 
 
 
210 aa  251  4e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.33 
 
 
226 aa  251  5e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.87 
 
 
217 aa  251  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.87 
 
 
217 aa  251  8e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55 
 
 
258 aa  250  9e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.87 
 
 
212 aa  249  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.08 
 
 
213 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.71 
 
 
214 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.01004e-05 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.24 
 
 
214 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.49 
 
 
217 aa  245  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.76 
 
 
214 aa  242  2e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.72 
 
 
215 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60 
 
 
202 aa  241  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.33 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.33 
 
 
215 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.33 
 
 
215 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.92 
 
 
213 aa  238  7e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.02 
 
 
211 aa  237  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.41 
 
 
215 aa  237  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.41 
 
 
215 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.19 
 
 
217 aa  235  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.94 
 
 
215 aa  235  5e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.94 
 
 
215 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.14 
 
 
229 aa  231  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  56.46 
 
 
217 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.81 
 
 
211 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.23 
 
 
215 aa  228  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.98 
 
 
214 aa  226  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.48 
 
 
212 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.48 
 
 
212 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.66 
 
 
215 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.66 
 
 
215 aa  219  2e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.19 
 
 
261 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.11 
 
 
231 aa  218  4e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.14 
 
 
212 aa  216  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.52 
 
 
214 aa  215  3e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
221 aa  214  6e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.32 
 
 
225 aa  214  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
217 aa  211  5e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.76 
 
 
209 aa  211  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.61 
 
 
212 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.94 
 
 
224 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1481  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.33 
 
 
217 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  0.265561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  47.14 
 
 
212 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.26 
 
 
213 aa  204  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2606  pyridoxal 5'-phosphate synthase  47.66 
 
 
213 aa  204  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.44 
 
 
222 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.72 
 
 
214 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.912565  decreased coverage  3.90202e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50 
 
 
213 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4542  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.42 
 
 
214 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.76 
 
 
218 aa  201  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.23 
 
 
221 aa  201  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.74 
 
 
210 aa  200  1e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.97 
 
 
213 aa  200  1e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.85 
 
 
201 aa  199  2e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1016  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.67 
 
 
196 aa  199  2e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.92 
 
 
213 aa  199  2e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  46.67 
 
 
215 aa  199  2e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.55 
 
 
206 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  46.19 
 
 
215 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.77 
 
 
208 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.867273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>