158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0099 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  71.88 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  54.46 
 
 		 330 aa  351  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  54.46 
 
 		 322 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  54.78 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.47 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.47 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.47 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.47 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.47 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.47 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.47 
 
 		 309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  43.26 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.51 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  43.27 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  43.27 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  42.95 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  42.95 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  42.95 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  42.95 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  46.86 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  43.39 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  44.88 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  37.12 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  34.95 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  34.66 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  34.66 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  35.58 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  34.8 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  37.12 
 
 		 326 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  33.97 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  32.7 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  34.66 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  36.96 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  29.91 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  29.87 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  29.87 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  30.72 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.99 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.38 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  26.9 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  26.5 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  25.24 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  26.28 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  25.07 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  26.38 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  25.64 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  28.84 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.23 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  23.55 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  27.27 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  26.81 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  29.86 
 
 		 433 aa  92.4  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  27.15 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  25.16 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  23.55 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  24.85 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  25.62 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.28 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  24.71 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  27.38 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  26.61 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  25.95 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.52 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  28.28 
 
 		 579 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.54 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.85 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  22.85 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  24.52 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  25.32 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  25.16 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.14 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  26.03 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  23.03 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  22.44 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  21.59 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  22.77 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  23.81 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  24.6 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  24.39 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.9 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  22.41 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  21.73 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  27.92 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  24.16 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  29.06 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  24.09 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  23.4 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  22.04 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  22.04 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  25.11 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  21.76 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  26.58 
 
 		 455 aa  68.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  24.83 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  24.08 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>