37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0037 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0037  lipoprotein  100 
 
 
405 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0108  putative lipoprotein  55.53 
 
 
385 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5690  putative lipoprotein  59.78 
 
 
397 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0124  putative lipoprotein  55.53 
 
 
385 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0315  putative lipoprotein  55.53 
 
 
385 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000873186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0078  hypothetical protein  55.95 
 
 
386 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2263  lipoprotein  57.92 
 
 
391 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3911  hypothetical protein  55.07 
 
 
385 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3404  hypothetical protein  55.07 
 
 
385 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6452  hypothetical protein  54.82 
 
 
385 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5951  hypothetical protein  54.82 
 
 
385 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195751  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5587  hypothetical protein  54.82 
 
 
385 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4582  putative lipoprotein  53.28 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1914  putative lipoprotein  46.87 
 
 
388 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1814  putative lipoprotein  46.87 
 
 
388 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0659201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3517  putative lipoprotein  44.56 
 
 
392 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00869798  normal  0.0619249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0056  putative lipoprotein  41.49 
 
 
401 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2311  hypothetical protein  38.63 
 
 
476 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.466127  normal  0.419829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14730  hypothetical protein  31.25 
 
 
274 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000225016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1740  hypothetical protein  30.75 
 
 
375 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.049047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2772  hypothetical protein  34.01 
 
 
310 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2141  hypothetical protein  30.75 
 
 
376 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.19798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1816  hypothetical protein  30.55 
 
 
375 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.202268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1754  hypothetical protein  39.11 
 
 
304 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.477178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1468  hypothetical protein  35.6 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.314468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03570  probable lipoprotein  39.06 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.758771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1556  hypothetical protein  35.93 
 
 
309 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0978629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4236  hypothetical protein  28.84 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0552  putative lipoprotein  33.14 
 
 
295 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2018  hypothetical protein  30.15 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0681  putative lipoprotein  32.76 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0241  hypothetical protein  32.92 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000967263  hitchhiker  0.000000000125048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0736  putative lipoprotein  31.98 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3095  hypothetical protein  23.61 
 
 
298 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0967  hypothetical protein  27.27 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2615  hypothetical protein  27.92 
 
 
554 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0950  hypothetical protein  27.11 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>