More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4328 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  822    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 		 1833 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  37.44 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  32.11 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 425 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  34.4 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  36.8 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  35.38 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  29.55 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  28.54 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  33.6 
 
 		 1816 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 463 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.57 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  26.83 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.24 
 
 		 1776 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  33.42 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.42 
 
 		 1839 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.13 
 
 		 1864 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.64 
 
 		 1829 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.25 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 422 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.81 
 
 		 1876 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.06 
 
 		 2720 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 432 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  33.24 
 
 		 1769 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.81 
 
 		 422 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.2 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.94 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.61 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.44 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.44 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.44 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.44 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.44 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.94 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.66 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.69 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.94 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.66 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.39 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.66 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.68 
 
 		 1806 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.12 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.12 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  27.39 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.52 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  27.06 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  27.06 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  27.01 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  19.81 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  27.63 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 413 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.68 
 
 		 927 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>