107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3373 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  99.46 
 
 
259 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  98.38 
 
 
245 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  96.22 
 
 
259 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  76.62 
 
 
200 aa  316  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  82.7 
 
 
245 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  78.92 
 
 
265 aa  311  7e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  65.98 
 
 
244 aa  305  4e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  63.39 
 
 
258 aa  305  4e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  65.42 
 
 
230 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  61.67 
 
 
217 aa  282  4e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  59.31 
 
 
230 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  72.34 
 
 
259 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  61.47 
 
 
222 aa  274  1e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  51.67 
 
 
229 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  50.59 
 
 
260 aa  264  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  51.52 
 
 
243 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  53.02 
 
 
239 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  53.88 
 
 
232 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  50.87 
 
 
229 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  53.54 
 
 
248 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  53.54 
 
 
248 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  52.16 
 
 
218 aa  241  8e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  51.05 
 
 
229 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  50.42 
 
 
250 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  50.42 
 
 
250 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  1.36516e-06  unclonable  2.39983e-09 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  46.96 
 
 
217 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  47.39 
 
 
217 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  50 
 
 
227 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  44.29 
 
 
232 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  35.95 
 
 
274 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  65.75 
 
 
114 aa  109  4e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  33.2 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  33.65 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  27.99 
 
 
284 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  29.87 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  30.04 
 
 
259 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  28.85 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  2.13894e-05  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 
252 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
243 aa  83.6  3e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
243 aa  83.6  3e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  33.15 
 
 
249 aa  81.3  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  32.6 
 
 
235 aa  80.5  2e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  28.27 
 
 
256 aa  80.1  3e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  28.51 
 
 
255 aa  78.2  1e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  27.2 
 
 
240 aa  73.9  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  36.22 
 
 
261 aa  72.8  5e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  31.44 
 
 
237 aa  71.2  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  29.52 
 
 
222 aa  70.9  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  30.91 
 
 
254 aa  70.9  2e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
272 aa  69.7  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  26.86 
 
 
255 aa  68.2  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  27.37 
 
 
212 aa  68.6  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
247 aa  67.8  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  8.09595e-07  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  25.63 
 
 
226 aa  65.9  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  1.32368e-06  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
239 aa  65.5  8e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  25.65 
 
 
227 aa  61.6  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
226 aa  58.9  8e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  28.87 
 
 
245 aa  58.9  8e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  25.84 
 
 
225 aa  54.3  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  27.16 
 
 
210 aa  53.5  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  1.9093e-05  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  24.4 
 
 
281 aa  53.1  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
252 aa  51.2  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  28.64 
 
 
319 aa  50.8  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  24.4 
 
 
260 aa  50.8  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  28.64 
 
 
332 aa  50.8  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  28.64 
 
 
330 aa  50.4  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  33.17 
 
 
261 aa  49.7  4e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  36.14 
 
 
257 aa  49.7  5e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  22.92 
 
 
187 aa  48.9  6e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  31.48 
 
 
259 aa  49.3  6e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  29.17 
 
 
241 aa  48.9  7e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  32.87 
 
 
287 aa  48.9  8e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  27.63 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  27.64 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  44.9 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  31.94 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.58134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  35.94 
 
 
195 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  35.85 
 
 
187 aa  45.8  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  36 
 
 
187 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.32173e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  28.94 
 
 
319 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.87 
 
 
191 aa  45.4  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  28.4 
 
 
184 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  27.5 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  31.03 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  35.19 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  28.87 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  42.86 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  1.14136e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  26.46 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  51.35 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.61 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  23.17 
 
 
181 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  47.37 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  32.02 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>