110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2910 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  524  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  84.65 
 
 
200 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  80 
 
 
259 aa  316  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  78.92 
 
 
245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  78.92 
 
 
245 aa  311  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  78.92 
 
 
259 aa  311  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  78.38 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  61.75 
 
 
258 aa  285  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  61.07 
 
 
244 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  61.3 
 
 
230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  63.51 
 
 
217 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  64.18 
 
 
222 aa  265  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  53.48 
 
 
239 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  66.49 
 
 
259 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  51.6 
 
 
260 aa  259  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  55.81 
 
 
229 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  54.75 
 
 
230 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  55.31 
 
 
232 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  51.83 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  54.13 
 
 
229 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  60.45 
 
 
248 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  60.45 
 
 
248 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  58.33 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  51.61 
 
 
229 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  51.92 
 
 
217 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  51.92 
 
 
217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  50 
 
 
250 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  50 
 
 
250 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  53.67 
 
 
232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  50.23 
 
 
227 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  62.2 
 
 
114 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  36.43 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  39.68 
 
 
254 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  31.13 
 
 
231 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  30.7 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 
225 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  29.84 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  29.15 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  28.76 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  37.86 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  33.2 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  28.76 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  38.24 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  34.69 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  29.02 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  29.02 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  27.68 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  26.96 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  27.19 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  27.92 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  27.96 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  27.06 
 
 
227 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  26.89 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  29.22 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  26.15 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  29.25 
 
 
252 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  32.35 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  27.53 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  28.17 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  29.91 
 
 
295 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  53.49 
 
 
200 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  45.83 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  30.77 
 
 
350 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  25.47 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  33.22 
 
 
319 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  28.14 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  32.65 
 
 
195 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  32 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  32.1 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  45.24 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  37.97 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  29.17 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  30.71 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  27.15 
 
 
332 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 
281 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  28.08 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  45.95 
 
 
187 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.07 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  26.88 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  30.67 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  22.66 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  35.9 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  42.19 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  29.33 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  34.8 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  33.96 
 
 
187 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  30.67 
 
 
191 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  25.32 
 
 
184 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>