86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0825 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  80.04 
 
 
458 aa  723    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
460 aa  936    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  31.51 
 
 
486 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  28.73 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  30.57 
 
 
497 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6743  phosphoesterase PHP domain protein  30.74 
 
 
541 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  35.56 
 
 
407 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  32.79 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  33.14 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  34.67 
 
 
403 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  32.6 
 
 
331 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  35.37 
 
 
401 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  23.91 
 
 
460 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2798  hypothetical protein  21.8 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.44646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4132  hypothetical protein  28.01 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  27.62 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2823  PHP domain protein  23.06 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  31.75 
 
 
244 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  31.28 
 
 
227 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  29.75 
 
 
221 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3287  hypothetical protein  23.46 
 
 
813 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  28.5 
 
 
221 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  31.07 
 
 
228 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0319  phosphotransferase domain-containing protein  25.69 
 
 
546 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.888377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2143  hypothetical protein  24.11 
 
 
757 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544193  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1962  hypothetical protein  24.8 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0805499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1841  phosphotransferase domain-containing protein  30.41 
 
 
382 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1581  phosphotransferase domain-containing protein  30.92 
 
 
306 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  27.47 
 
 
640 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  30.58 
 
 
228 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  24.42 
 
 
291 aa  57.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  30.48 
 
 
241 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  28.57 
 
 
223 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  31.4 
 
 
216 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0337  phosphotransferase domain-containing protein  28.27 
 
 
546 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4309  phosphotransferase domain-containing protein  27.66 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  22.26 
 
 
809 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  30.1 
 
 
228 aa  54.7  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
224 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  26.96 
 
 
225 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1007  hypothetical protein  22.94 
 
 
771 aa  53.9  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  29.24 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2621  phosphotransferase domain-containing protein  29.05 
 
 
266 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.88374  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  29.72 
 
 
228 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3335  phosphotransferase domain-containing protein  27.89 
 
 
300 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.219071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  31.25 
 
 
240 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1232  PHP-like  46.48 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469628  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2583  phosphotransferase domain-containing protein  35.07 
 
 
364 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3405  hypothetical protein  23.88 
 
 
565 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0442965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  22.49 
 
 
2254 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2550  phosphotransferase domain-containing protein  28.65 
 
 
352 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.393848  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  26.92 
 
 
295 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  29.73 
 
 
215 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  27.96 
 
 
221 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0025  phosphotransferase domain-containing protein  27.13 
 
 
742 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.04569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  36.78 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  26.98 
 
 
249 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  27.78 
 
 
299 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2797  PHP domain protein  33.86 
 
 
369 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  25.62 
 
 
803 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  29.25 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1312  PHP domain protein  28.5 
 
 
264 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250099  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1554  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  23.7 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.832724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1414  hypothetical protein  26.55 
 
 
214 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00470799  normal  0.0153029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2616  phosphoesterase, PHP-like  33.86 
 
 
371 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0707  PHP-like protein  39.71 
 
 
297 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.421553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2584  hypothetical protein  24.35 
 
 
777 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0639598  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  31.25 
 
 
216 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09811  metal-dependent phosphoesterase  24.24 
 
 
215 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  29.87 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  34.78 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  27.16 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2702  PHP domain protein  33.86 
 
 
369 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0385  PHP-like  24.29 
 
 
227 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.838582  normal  0.0911256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  28.37 
 
 
252 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  34.33 
 
 
288 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09621  metal-dependent phosphoesterase  22.39 
 
 
215 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  35.44 
 
 
301 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09791  metal-dependent phosphoesterase  23.74 
 
 
215 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.922967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  29.17 
 
 
235 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  26.9 
 
 
226 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0474  PHP domain protein  30.17 
 
 
211 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.373007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  20.59 
 
 
333 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  29.89 
 
 
578 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  29.89 
 
 
594 aa  43.1  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1860  PHP domain protein  27.01 
 
 
219 aa  43.1  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>