53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1962 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1962  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0805499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2550  phosphotransferase domain-containing protein  36 
 
 
352 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.393848  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1841  phosphotransferase domain-containing protein  35.33 
 
 
382 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  34.96 
 
 
353 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1915  phosphoesterase, PHP-like protein  37.18 
 
 
351 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289767  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2823  PHP domain protein  31.91 
 
 
352 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4303  PHP domain protein  27.78 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0371688  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  24.86 
 
 
480 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  23.53 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2583  phosphotransferase domain-containing protein  22.97 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  26 
 
 
458 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  23.74 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2797  PHP domain protein  24.29 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  24.8 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  23.86 
 
 
221 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2616  phosphoesterase, PHP-like  25.6 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  28.87 
 
 
497 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2702  PHP domain protein  25.6 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  32.14 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  33.65 
 
 
235 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  31.25 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  32.14 
 
 
255 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  32.14 
 
 
267 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  31.07 
 
 
241 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  29.41 
 
 
240 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  23.64 
 
 
225 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  30 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  23.12 
 
 
228 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  28.46 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  26.39 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  23.46 
 
 
221 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  25.68 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 
224 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  29.81 
 
 
223 aa  49.3  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1404  hypothetical protein  35.29 
 
 
215 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  26.39 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  24.14 
 
 
452 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  36.47 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  25.95 
 
 
227 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  29.91 
 
 
425 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  43.18 
 
 
536 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  21.51 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  25.71 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  32.88 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  27.72 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  24.05 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1597  phosphotransferase domain-containing protein  23.29 
 
 
221 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1381  phosphotransferase domain-containing protein  31.25 
 
 
259 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  26.92 
 
 
232 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1414  hypothetical protein  30.39 
 
 
214 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00470799  normal  0.0153029 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  26.55 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  22.18 
 
 
249 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  21.67 
 
 
228 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>