75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2550 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2550  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
352 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.393848  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1841  phosphotransferase domain-containing protein  87.43 
 
 
382 aa  620  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1172  PHP domain protein  61.27 
 
 
353 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0555616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1962  hypothetical protein  36 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0805499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2823  PHP domain protein  32.69 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1915  phosphoesterase, PHP-like protein  36.07 
 
 
351 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289767  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4303  PHP domain protein  33.33 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0371688  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2583  phosphotransferase domain-containing protein  25.98 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  33.01 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  35.78 
 
 
240 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  26.59 
 
 
425 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  31.14 
 
 
244 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  32.61 
 
 
241 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  34.34 
 
 
216 aa  63.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  38.1 
 
 
497 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  34.91 
 
 
221 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  39 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  32.41 
 
 
227 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  38.24 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0733  PHP domain protein  35.04 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.910762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  29.41 
 
 
228 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
224 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  24.41 
 
 
291 aa  56.2  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  33.33 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2797  PHP domain protein  34.02 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  31.13 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2616  phosphoesterase, PHP-like  35.05 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  27.61 
 
 
295 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  39.62 
 
 
221 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  25.15 
 
 
299 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  28.06 
 
 
249 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  38 
 
 
221 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  29.73 
 
 
308 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  25.93 
 
 
297 aa  52.8  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  37.38 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  25.77 
 
 
299 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  26.12 
 
 
452 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  27.45 
 
 
403 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  27.01 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  27.87 
 
 
252 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  28.64 
 
 
486 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1258  phosphotransferase domain-containing protein  24.55 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.331098  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  28.65 
 
 
460 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  31.73 
 
 
232 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  30.39 
 
 
228 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3316  PHP domain protein  29.41 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.247221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2785  PHP domain protein  29.41 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3419  PHP domain protein  27.34 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  37.27 
 
 
458 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  21.01 
 
 
460 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  30.48 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09811  metal-dependent phosphoesterase  29.17 
 
 
215 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  46.34 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  55.56 
 
 
570 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6743  phosphoesterase PHP domain protein  36.36 
 
 
541 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1104  phosphoesterase PHP domain protein  34.88 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2902  PHP domain protein  29.41 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10031  metal-dependent phosphoesterase  29.03 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.283504  normal  0.395937 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09791  metal-dependent phosphoesterase  29.17 
 
 
215 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.922967  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  30.77 
 
 
223 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2482  hypothetical protein  21.43 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1254  phosphoesterase PHP-like  25.4 
 
 
260 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0920  phosphoesterase PHP-like  28.47 
 
 
215 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.210854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2909  PHP domain protein  57.14 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.308532  normal  0.0259754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  33.62 
 
 
331 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  40.74 
 
 
536 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0713  phosphotransferase domain-containing protein  21.7 
 
 
219 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  44.44 
 
 
570 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  44.64 
 
 
288 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  44.44 
 
 
570 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  40.74 
 
 
1710 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0584  PHP domain protein  27.78 
 
 
217 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  38.78 
 
 
532 aa  42.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2798  hypothetical protein  22.05 
 
 
475 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.44646  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  43.24 
 
 
576 aa  42.7  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>