74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3335 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3335  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.219071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4309  phosphotransferase domain-containing protein  83.33 
 
 
300 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1581  phosphotransferase domain-containing protein  53.11 
 
 
306 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3024  phosphotransferase domain-containing protein  28.21 
 
 
331 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.951388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3026  phosphotransferase domain-containing protein  28.05 
 
 
329 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  30.03 
 
 
291 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  28.8 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  30.49 
 
 
458 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3419  PHP domain protein  36.45 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  29.22 
 
 
460 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  24.78 
 
 
460 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  25.56 
 
 
486 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1119  phosphoesterase PHP-like  32 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.299975  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14921  metal-dependent phosphoesterase  31.1 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.404692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1904  hypothetical protein  25.91 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0584132  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  24.38 
 
 
809 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0378  phosphotransferase domain-containing protein  26.81 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000646599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  25.1 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0756  phosphotransferase domain-containing protein  24.18 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.803092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  25.34 
 
 
232 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  28.25 
 
 
452 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  51.16 
 
 
646 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6743  phosphoesterase PHP domain protein  27.92 
 
 
541 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  35.29 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  57.89 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09811  metal-dependent phosphoesterase  23.56 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  27.62 
 
 
221 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  46.94 
 
 
573 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0099  PHP domain protein  30.4 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2382  phosphoesterase domain-containing protein  30.23 
 
 
524 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  26.54 
 
 
572 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  26.54 
 
 
573 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  26.54 
 
 
572 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  55.26 
 
 
334 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09791  metal-dependent phosphoesterase  23.56 
 
 
215 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.922967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  26.54 
 
 
572 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  26.54 
 
 
573 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  30.56 
 
 
216 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  50 
 
 
572 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  50 
 
 
573 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  50 
 
 
572 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  50 
 
 
573 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0133  PHP domain protein  28 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000141938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  50 
 
 
572 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  50 
 
 
572 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  51.22 
 
 
331 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  36.17 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2798  hypothetical protein  23.29 
 
 
475 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.44646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  37.21 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  29.86 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  29.19 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  56.76 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09621  metal-dependent phosphoesterase  22.56 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  50 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  35.8 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  54.05 
 
 
577 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  50 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  51.35 
 
 
592 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  50 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0145  PHP domain protein  21.95 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.250685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  48.65 
 
 
560 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  52.63 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0920  phosphoesterase PHP-like  25.19 
 
 
215 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.210854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1115  PHP domain protein  46.81 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.0045809  normal  0.0281619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15290  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  41.54 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00297509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  32.47 
 
 
407 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  52.63 
 
 
344 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001078  hypothetical protein  23.12 
 
 
748 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  33.77 
 
 
401 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1359  phosphoesterase PHP-like  30.36 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  60 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  47.22 
 
 
569 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  54.05 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  54.05 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>