79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4309 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4309  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3335  phosphotransferase domain-containing protein  83.33 
 
 
300 aa  481  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.219071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1581  phosphotransferase domain-containing protein  52.65 
 
 
306 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3024  phosphotransferase domain-containing protein  27.9 
 
 
331 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.951388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3026  phosphotransferase domain-containing protein  28.53 
 
 
329 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  30.74 
 
 
291 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  27.05 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  28.22 
 
 
458 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  22.96 
 
 
460 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  27.43 
 
 
460 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6743  phosphoesterase PHP domain protein  27.83 
 
 
541 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3419  PHP domain protein  32.08 
 
 
411 aa  52.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1119  phosphoesterase PHP-like  28.8 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.299975  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14921  metal-dependent phosphoesterase  30.67 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.404692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1904  hypothetical protein  26.69 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0584132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2582  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 
224 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  26.29 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09621  metal-dependent phosphoesterase  23.59 
 
 
215 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001078  hypothetical protein  22.96 
 
 
748 aa  48.9  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259566  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09811  metal-dependent phosphoesterase  24.43 
 
 
215 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  48.84 
 
 
646 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09791  metal-dependent phosphoesterase  24.43 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.922967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  52.38 
 
 
572 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  39.08 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  40.2 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  52.38 
 
 
572 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  54.05 
 
 
572 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  47.5 
 
 
573 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  54.05 
 
 
573 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  52.38 
 
 
573 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  54.05 
 
 
573 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  54.05 
 
 
573 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  52.38 
 
 
572 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  52.38 
 
 
572 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  52.38 
 
 
572 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  52.38 
 
 
572 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1359  phosphoesterase PHP-like  28.09 
 
 
215 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2798  hypothetical protein  21.37 
 
 
475 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.44646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  54.05 
 
 
560 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  45.83 
 
 
584 aa  45.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  39.29 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0920  phosphoesterase PHP-like  23.66 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.210854  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1626  phosphotransferase domain-containing protein  60 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1254  phosphoesterase PHP-like  47.73 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  52.94 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  48.65 
 
 
592 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0099  PHP domain protein  29.06 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0133  PHP domain protein  29.91 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000141938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  37.8 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  51.35 
 
 
572 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0812  phosphotransferase domain-containing protein  29.55 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0756  phosphotransferase domain-containing protein  37.7 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.803092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10031  metal-dependent phosphoesterase  26.4 
 
 
231 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.283504  normal  0.395937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  38.27 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  62.86 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3236  PHP-like  50 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0330  phosphoesterase PHP, N-terminal  26.4 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  52.38 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  62.86 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  38.1 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  52.63 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  34.62 
 
 
569 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  45.95 
 
 
574 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  54.29 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  60 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  40.82 
 
 
401 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  44.44 
 
 
569 aa  42.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  32.24 
 
 
403 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  51.35 
 
 
543 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  51.35 
 
 
588 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3826  PHP-like  60 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  0.059434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  39.58 
 
 
614 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  48.65 
 
 
582 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  48.65 
 
 
582 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  54.05 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  35.48 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  54.05 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  35.45 
 
 
276 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>