More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0824 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  88.14 
 
 		 435 aa  777    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  887    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  48.95 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  48.1 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  48.1 
 
 		 474 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.31 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.23 
 
 		 447 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.99 
 
 		 447 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.69 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  42.45 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.47 
 
 		 453 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.1 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  46.41 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.59 
 
 		 442 aa  339  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.32 
 
 		 471 aa  338  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.36 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.27 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.68 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  41.01 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  41.01 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  41.24 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.01 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  40.78 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  41.01 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  41.2 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  41.01 
 
 		 442 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  40.78 
 
 		 442 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.12 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  40.78 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.73 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.02 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  43.06 
 
 		 449 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  42.55 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43 
 
 		 543 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  40.09 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.5 
 
 		 463 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  42.62 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  43.24 
 
 		 426 aa  308  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.76 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.88 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  44.82 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.99 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  42.93 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  42.62 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  40.62 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  38.61 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  42.58 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  38.33 
 
 		 435 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  41.47 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  41.89 
 
 		 412 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.16 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.08 
 
 		 413 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.94 
 
 		 445 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  37.74 
 
 		 413 aa  269  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0182  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  38.48 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  40.14 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.48 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.84 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  38.46 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  39.66 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  39.58 
 
 		 430 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  39.18 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.39 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.53 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  35.14 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  37.29 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  37.47 
 
 		 439 aa  253  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  37.32 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  36.84 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  37.23 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.77 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  32.87 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  37.47 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.62 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.41 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.65 
 
 		 437 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  36.41 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.3 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.33 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.06 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.41 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.02 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.75 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.91 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  36.84 
 
 		 446 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.73 
 
 		 415 aa  236  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  37.05 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.3 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.99 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.74 
 
 		 424 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  37.56 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.52 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.87 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  35.48 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.24 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.66 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.41 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.8 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  36.87 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.66 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>